|
|
تنوع ژنتیکی ماهی حلوا سفید(pampus agenteus) دریای عمان و خلیج فارس با استفاده از نشانگرهای مولکولی ریزماهواره و pcr-rflp
|
|
|
|
|
نویسنده
|
گلستانی نازلی ,رضوانی گیلکلایی سهراب ,صفری رقیه
|
منبع
|
توسعه آبزي پروري - 1395 - دوره : 10 - شماره : 2 - صفحه:109 -117
|
چکیده
|
ماهی حلوا سفید یکی از گونههای با ارزش شیلاتی و کاندید مناسب آبزی پروری است که جمعیتهای آن بهعلت صید بیرویه و تغییرات اکولوژیکی کاهش یافته است. در مطالعه حاضر ساختار جمعیتی ماهی حلوا سفید در دریای عمان و خلیج فارس با استفاده از ژن nd2 و 7 نشانگر ریزماهواره مورد مطالعه قرار گرفت. بدین منظور 100 نمونه ماهی از مناطق کویت، خوزستان، بوشهر و چابهار جمعآوری شد. با استفاده از 16 آنزیم محدودالاثر استفاده شده تنوع هاپلوتیپی و نوکلئوتیدی داخل جمعیتها بهترتیب (00143/0 ± 0875/0)، (0000004/0 ± 001238/0) تخمین زده شد. همچنین بر اساس تست monte- carlo اختلاف آماری معنیداری از لحاظ پراکنش هاپلوتیپها در مناطق مختلف مورد بررسی مشاهده نشد (p>05/0 و 8/62x2 =) که نشاندهنده وجود یک جمعیت از این گونه در دریای عمان و خلیج فارس میباشد اما با استفاده از نشانگر ریزماهواره میانگین هتروزیگوسیتی مشاهده شده و مورد انتظار بهترتیب 53/0 و 67/0 محاسبه گردید. بررسی تعادل هاردی- واینبرگ انحراف از تعادل را در اکثر جایگاهها نشان داد (p<05/0). بر اساس تست fst اختلاف معنیداری میان کلیه مناطق نمونه برداری مشاهده شد (p<01/0). بهطور کلی نتایج بهدست آمده حاکی از برتری نشانگر ریزماهواره به نشانگر pcr-rflp در تشخیص تنوع ژنتیکی و تعیین ساختار جمعیتی این گونه میباشد.
|
کلیدواژه
|
تنوع ژنتیکی، ماهی حلوا سفید، pcr-rflp، ریزماهواره، خلیج فارس و دریای عمان
|
آدرس
|
دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات, ایران, سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی, ایران, دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان, دانشکده شیلات و محیط زیست, گروه تکثیر و پرورش آبزیان, ایران
|
پست الکترونیکی
|
rsafari@gau.ac.ir
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Genetic diversity of Silver pomfret, Pampus argenteus in the Persian Gulf and Oman Sea by using microsatellite and mt DNA RFLP
|
|
|
Authors
|
Golestani N. ,Rezvani Gilkolaee S. ,Safari R.
|
Abstract
|
Silver pomfret, Pampus argenteus, is a commercially highvalue species and a good candidate for aquaculture development which is now under environmental pressure due to overfishing and other ecological changes. In the present study, population structure of silver pomfret from Oman Sea and Persian Gulf were investigated using 7 microsatellite loci and restriction fragment length polymorphisms (RFLP) of the mitochondrial ND2 gene region. For this purpose 100 samples were collected from 4 locations (kuwaiti waters, khozestan, Bushehr and Chabahar). By using 16 restriction enzymes, the estimates of mtDNA haplotype and nucleotide diversity were (h = 0.0875 ± 0.00143, π = 0.001238 ± 0.0000004). The result for testing of homogeneity in haplotype frequencies by montecarlo test was (χ2 = 68.8, P> 0.05) which showed that a monophylitic population lives in Oman Sea and Persian Gulf. However,the average of observed and expected heterozygosity was 0.53 and 0.67 respectively. After appling the HardyWeinberg Equilibrium (HWE) tests, most of loci were found to deviate significantly from HWE in some populations in which deficiency of heterozygosity was apparent. Pairwse Fst valus showed significant difference between all studied populations (P<0.01). Results indicated that microsatellite markers are more powerful than PCRRFLP in determination of genetic diversity and population structure in this species.
|
Keywords
|
Silver pomfret ,Microsatellite ,PCR RFLP ,PCRRFLP
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|