شناسایی گونه‌های لاکتوباسیل مزوفیل موجود در روده ماهیان سفید (rutilus kutum kamensky, 1901) دریای خزر با تست تاییدی pcr

لاکتوباسیل ها گونه های باکتری گرم مثبت، بدون اسپور، کاتالاز منفی میله ای می باشند که دارای نقش اکولوژیکی مهمی در دستگاه گوارش می باشند که شامل تولید مواد ضد میکروبی، افزایش پاسخ سیستم ایمنی و افزایش قابلیت دسترسی مواد مغذی است. جهت شناسایی لاکتوباسیل های موجود در روده ماهیان سفید اقدام به صید تعداد 40 قطعه ماهی به صورت تصادفی از دریای خزر گردید. سپس نمونه ها تحت شرایط استریل و در مجاورت یخ به آزمایشگاه میکروب شناسی دانشکده دامپزشکی دانشگاه آزاد واحد تبریز منتقل و بعد از بررسی فنوتیپیکی و بیوشیمیایی، 10 نمونه لاکتوباسیل موردنظر برای تشخیص گونه ها بر اساس ساختار مولکولی ژن srdna 16، اقدام به استخراج dna و شناسایی لاکتوباسیل ها با پرایمر اختصاصی نموده و سپس به منظور شناسایی اولیه گونه ها از آنزیم برشی taq1 استفاده گردید. سپس 3 نمونه متفاوت به منظور تشخیص قطعی جهت توالی یابی ارسال گردید. نتایج توالی یابی حاکی از تشابه 9997% توالی های موردنظر با توالی های ژن های srdna 16 ثبت شده در بانک اطلاعاتی برای گونه لاکتوباسیلوس فرمنتوم بود و تنها یک نمونه تشابه 89% با گونه لاکتوباسیلوس فرمنتوم (lactobacillus fermentum) داشت که نمونه موردنظر برای توالی یابی به صورت پارشیال فرستاده شد و بعد توالی یابی با شماره ژن jq906262 تحت عنوان lactobacillus sp. ru1 16s ribosomal rna gene, partial sequence در سایت ncbi ثبت شد.