assessment of genetic diversity in accessions of pearl millet (pennisetum glaucum) and napier grass (pennisetum purpureum) using microsatellite (issr) markers

Pearl millet (pennisetum glaucum (l.) r. br.) and napier grass (pennisetum purpureum schumach) are the most economically important species in the genus pennisetum. knowledge of genetic diversity of these two species would enhance their potentials for utilization. the present work assessed the genetic diversity and phylogenetic relationship among nigerian and indian accessions of pearl millet and napier grass using microsatellite markers. we extracted genomic dna from each accession and carried out polymerase chain reaction using intersimple sequence repeat markers. data obtained were analyzed for genetic diversity using mega 4.0 software. a total of 48 loci consisting of 410 bands were generated with 56.25% polymorphism. principal coordinates analysis revealed three principal axis contributed significantly (70.20%) to the observed variations. accessions of napier grass from nigeria and india were plotted on a coordinate plane while pearl millets from both countries coexisted on different quadrants. cluster analysis, showed that nigeria and india accessions of napier grass were similar. consistent link of com-co-3 with nigeria napier grass and millet accessions suggested a common progenitor. the polymorphism obtained in this study showed that issr is an effective marker for assessment of genetic diversity and the connection between most accessions indicated that they have common progenitor.

مطالعه تنوع ژنتیکی جمعیت های Elaeagnus angustifolia L. بر اساس برخی صفات مورفولوژیک و نشانگرهای RAPD

سنجد (Elaeagnus angustifolia L.) یک درخت اروپا آسیایی است که بومی شده و دارای کاربردهای اکولوژیکی، دارویی و اقتصادی متنوع می باشد. در این مطالعه ترکیبی از صفات مورفولوژیک و نشانگرهای RAPD برای بررسی وجود یا عدم وجود ارتباط بین تنوع ژنتیکی و ویژگی های مورفولوژیک مابین پنج جمعیت گونه مذکور که از استان آذربایجان شرقی ایران جمع آوری شده بودند، استفاده شد. تجزیه داده های مربوط به ۱۹ صفت مختلف مورفولوژیک، براساس ماتریس فاصله ژنتیکی نی با استفاده از نرم افزار GenAlEx 6.5، فاصله ژنتیکی را بین 014/0 ( مابین جمعیت های جلفا و اهر) و 86/0 (مابین جمعیت های جلفا/ مرند و میانه) نشان داد. تجزیه خوشه ای براساس UPGMA و دندروگرام حاصله با استفاده از نرم افزار NTSYSpc 2.02، چهار خوشه اصلی را نشان داد. تجزیه داده های RAPD با استفاده از چهار آغازگر تصادفی تعداد ۲۹ باند چند شکل را ایجاد کرد. بنابراین، نمونه ها در چهار گروه قرار گرفتند. براساس ماتریس فاصله ژنتیکی نی، بیشترین فاصله ژنتیکی بین جمعیت های جلفا و میانه (167/0) و بیشترین ماتریس تشابه ژنتیکی بین جمعیت های جلفا و مرند (955/0) بود. در این تحقیق، نتایج حاصل از صفات مورفولوژیک و نشانگرهای RAPD سازگاری زیادی را با یکدیگر نشان دادند. نتایج ما نشان داد که تجزیه داده های RAPD روش مناسبی برای بررسی تنوع و روابط ژنتیکی بین جمعیت های سنجدمی باشد.