|
|
genetic diversity of dog rose (rosa canina l.) using issr markers
|
|
|
|
|
نویسنده
|
jamali maryam ,ghanbari alireza ,estaji asghar ,torabi giglou mousa ,saidi mahdi
|
منبع
|
iranian journal of genetics and plant breeding - 2019 - دوره : 8 - شماره : 2 - صفحه:1 -8
|
چکیده
|
Dog rose is one of the most important species in rosaceae family used as a medicinal plant and a rootstock for ornamental roses. this species is native to iran, therefore, identification of indigenous genotypes of this species is important for genetic preservation or breeding purposes. genetic diversity estimation of plant materials is one of the important prebreeding activities in breeding crops. in this study, genetic variation of 23 genotypes of r. canina was investigated using fifteen issr markers. the genotypes were collected from three regions of ardabil province (namin, nir and khalkhal). the results showed that all primers generated clear and consistent polymorphic bands (77% polymorphism) but, issr15 revealed a high numbers of polymorphic bands and was superior to other markers. also, the issr15 produced the highest number of polymorphic bands with seven scorable bands, while the ubc823 and ubc825 markers had the least number of bands (3 bands). the clustering pattern of genotypes was related to geographic regions. the genotypes from khalkhal region were separated from other genotypes (nir and namin genotypes) in cluster analysis. the results of the current study indicated that the issr markers separated genotypes based on geographic region. the best way to select parents is to use genotypes with high genetic distances. therefore, we determined the genetic distance among genotypes. according to the results, issr is an efficient marker system that can provide excellent information among r. canina genotypes. finally, the obtained results indicated that the r. canina genotypes investigated in this research have a wide genetic diversity.
|
کلیدواژه
|
genetic distance ,issr ,molecular markers and rosa canina
|
آدرس
|
university of mohaghegh ardabili, faculty of agriculture and natural resources, department of horticultural sciences, iran, university of mohaghegh ardabili, faculty of agriculture and natural resources, department of horticultural sciences, iran, university of mohaghegh ardabili, faculty of agriculture and natural resources, department of horticultural sciences, iran, university of mohaghegh ardabili, faculty of agriculture and natural resources, department of horticultural sciences, iran, university of ilam, faculty of agriculture, department of horticultural sciences, iran
|
پست الکترونیکی
|
m.saidi@ilam.ac.ir
|
|
|
|
|
|
|
|
|
ارزیابی تنوع ژنتیکی نسترن وحشی با استفاده از نشانگر ISSR
|
|
|
Authors
|
جمالی مریم ,قنبری علیرضا ,استاجی اصغر ,ترابی گیگلو موسی ,صیدی مهدی
|
Abstract
|
گل نسترن وحشی یکی از مهمترین گونههای خانواده رزاسه در ایران است که میتواند به عنوان گیاه دارویی و همچنین پایه برای دیگر گونههای رز استفاده شود. این گیاه بومی سرزمین ایران است، لذا شناسایی ژنوتیپهای بومی برای حفظ ذخایر ژنتیکی و اهداف اصلاحی مهم و حیاتی هستند. تخمین تنوع ژنتیکی مواد گیاهی یکی از فعالیتهای مهم در پیش اصلاح محصولات است. در پژوهش تنوع ژنتیکی، 23 ژنوتیپ نسترن وحشی با 15 نشانگر ISSR بررسی شد. ژنوتیپها از سه ناحیه مختلف استان اردبیل (نمین، نیر و خلخال) جمع آوری شدند. نتایج گواهی میدهد که همه پرایمرها، الگوی باندی واضح و چند شکل (77% چند شکلی) را نشان میدهند؛ اما آغازگر 15 تعداد باند چند شکل بیشتری را آشکار کرد که از این لحاظ از بقیه آغازگرها برتر بود. همچنین آغازگر 15 دارای بیشترین تعداد باند چند شکل با تعداد 7 باند و آغازگرهای UBC823 و UBC825 با سه باند کمترین باند چند شکل را تولید کردند. الگوی تجزیه کلاستر ژنوتیپ ها منطبق با نواحی جغرافیایی نمونهها بود، بطوری که ژنوتیپهای خلخال از ژنوتیپهای نواحی نیر و نمین جدا شدند. همچنین نتایج حاکی از آن بود که نشانگر ISSR توانسته است ژنوتیپها را براساس مناطق جغرافیایی از یکدیگر جدا کند. با تعیین فاصله ژنتیکی بین ژنوتیپها، بهترین والدین، ژنوتیپهایی با فاصله ژنتیکی زیاد است. براساس نتایج، نشانگر ISSR یک سیستم نشانگری مفید است که میتواند اطلاعات عالی از ژنوتیپ های نسترن وحشی فراهم کند. در نهایت نتایج بدست آمده نشان داد ژنوتیپهای نسترن وحشی در این تحقیق دارای تنوع ژنتیکی مطلوبی هستند.
|
Keywords
|
فاصله ژنتیکی، نشانگر مولکولی، نسترن وحشی
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|