|
|
انتخاب مناسبترین ژنهای رفرنس جهت مطالعات Real-time PCR در مراحل ابتدایی زیست تاسماهی ایرانی، Acipenser persicus
|
|
|
|
|
نویسنده
|
اکبرزاده آرش ,فرحمند حمید ,محجوبی فروزنده ,نعمت اللهی محمد علی ,حق بین کمال الدین ,کلنگی میاندره حامد
|
منبع
|
بوم شناسي آبزيان - 1391 - دوره : 2 - شماره : 3 - صفحه:1 -13
|
چکیده
|
در مطالعاتی که از تکنیک pcr real-time کمی استفاده می شود، به منظور کمی سازی داده های حاصل از اندازه گیری سطوح mrna می بایست میزان mrna ژن هدف را نسبت به میزان mrna یک ژن رفرنس داخلی نرمال سازی کرد. از آنجا که سطح بیان ژن کنترل داخلی می بایست در بین بافتهای مختلف و نیز تمامی مراحل رشد یک موجود زنده ثابت بوده و نیز تحت تاثیر تیمارهای آزمایش قرار نگیرد، در هر یک از آزمایش های بیان ژن می بایست ثبات و پایداری بیان چندین ژن رفرنس مورد آزمایش و ارزیابی قرار گیرد تا مناسب ترین ژن رفرنس به منظور نرمال سازی داده های حاصل از بیان ژن هدف انتخاب گردد. در مطالعه حاضر ثبات بیان شش ژن رفرنس شامل actin- beta (actb)، glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase (gapdh)، ribosomal protein l6 (rpl6)، ubiquitin (ubq)، ribosomal protein l13 (rpl13) و elongation factor 1-alpha (ef1a) در طی مراحل ابتدایی رشد و تکامل تاسماهی ایرانی با استفاده از تکنیکreal-time pcr taqman مورد ارزیابی قرار گرفت. برآیند کلی نتایج حاصل از نرم افزارهای genorm، bestkeeper و normfinder نشان داد که دو ژن rpl6 و actb از بیشترین ثبات بیان ژن برخوردار بودند، در حالیکه ژن rpl13 بیشترین تغییرات بیان ژن را از خود نشان داد. بر این اساس استفاده از ژن های rpl6، actb و نیز میانگین هندسی آنها به منظور نرمال سازی داده های بیان ژن هدف در مراحل ابتدایی رشد و تکامل تاسماهی ایرانی و نیز سایر گونه های تاسماهیان توصیه می شود.
|
کلیدواژه
|
تاسماهیایرانی ,ژن رفرنس ,mRNA ,Real-TimePCR
|
آدرس
|
دانشگاه هرمزگان, گروه شیلات، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه هرمزگان, ایران, دانشگاه تهران, گروه شیلات و محیط زیست، دانشکده منابع طبیعی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران, ایران, پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری, ایران, دانشگاه تهران, گروه شیلات و محیط زیست، دانشکده منابع طبیعی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران, ایران, پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری, ایران, دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان, گروه شیلات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Authors
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|