تعیین ژن های کلیدی و مسیر های پیام رسانی سلولی دخیل در بیماری زایی و ایجاد انواع تهاجمی بیماری لوسمی/لنفوم بالغین مشتق از سلول های atll)t)

زمینه و هدف:لوسمی/لنفوم بالغین مشتق از سلول های t (atll) سرطانی با پیش آگهی بسیار ضعیف می باشد. atll به چهار زیر گروه حاد، مزمن، لنفوم و خاموش با پیش آگهی های بسیار متفاوت تقسیم می شود. در مطالعه حاضر سعی کردیم با استفاده از داده های بیان ژنی و روش های زیست‌ داده‌ ورزی به شناخت بهتر بیماری زایی atll و تفاوت های موجود بین زیر گروه های آن بپردازیم.مواد و روش‌ها: ژن های با بیان تغییر یافته در بین انواع مختلف atll مشخص شدند. با هدف تعیین ژن های کلیدی، شبکه ارتباطات پروتئینی میان ژن های حاصله ساخته شد. پس از غربال ژن های کلیدی بر اساس شاخص های مرکزیت شبکه ای، مسیر های پیام رسانی سلولی مرتبط با آنها مشخص شدند. یافته‌ها: در مقایسه نوع حاد با انواع مزمن و خاموش، مسیر های پیام رسانی سلولی دخیل در تنظیم عملکرد دستگاه ایمنی بیان متفاوتی دارند. در مقایسه نوع حاد و مزمن با افراد سالم، ژن های مرتبط با بدخیمی درگیر هستند. در مقایسه نوع خاموش با افراد سالم، مسیر های مربوط به عفونت ها مختل شده اند. در مقایسه ثانویه نیز مشخص گردید ژن های مربوط به تکثیر سلولی و بدخیمی ها در فرم حاد بیان بالاتر و ژن های مرتبط با دستگاه ایمنی در این بیماران بیان کمتری نسبت به باقی افراد داشته اند.نتیجه‌گیری:به نظر می رسد دستکاری های ویروس جهت فرار از دستگاه ایمنی و همچنین تقویت تکثیر سلول های آلوده نقش تعیین کننده ای در بروز نوع تهاجمی بیماری داشته باشد. بررسی های بیشتر می تواند موجب ابداع روش های نوین تشخیصی، تعیین پیش آگهی و حتی هدف های ژن درمانی گردد.

determining the key genes and cellular signaling pathways involved in the pathogenesis and development of aggressive types of adult leukemia/lymphoma derived from t (atll) cells

background: adult t-cell leukemia/lymphoma (atll) is a cancer with a very poor prognosis. atll has four subgroups, acute, chronic, lymphoma, and smoldering, with very different prognoses. in this study, we tried to better understand the pathogenesis of atll and the differences between its subgroups by using gene expression data and bioinformatics methods.methods: genes with altered expression were identified among different types of atll. in order to determine the key genes, the network of protein interactions between the resulting genes was constructed. after screening the hub genes based on the network centrality indices, the cell signaling pathways related to them were identified.results:comparing the acute type with the chronic and silent types, the cell signaling pathways involved in regulating the function of the immune system are expressed differently. in comparison of acute and chronic type with healthy people, genes related to malignancy are involved. in comparing the silenced type with healthy individuals, the pathways related to infections are disrupted. in the secondary comparison, it was found that the genes related to cell proliferation and malignancy in the acute form were expressed more and the genes related to the immune system were less expressed in these patients than in the rest of the population.conclusion:it seems that manipulations by the virus resulting in immune escape and also in increased proliferation of infected cells have a decisive role in the occurrence of the aggressive type of the disease. further investigations can lead to the development of new diagnostic methods, determining prognosis and even the detection of targets for gene therapy.