|
|
|
|
ردیابی سرولوژیکی و مولکولی ویروس موزاییک زرد جو در استان خراسان رضوی، ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
گرامی نوقابی محدثه
|
|
منبع
|
دانش بيماري شناسي گياهي - 1403 - دوره : 14 - شماره : 1 - صفحه:1 -8
|
|
چکیده
|
موزاییک زرد ناشی از ویروس موزاییک زرد جو (baymv)، که توسط شبه قارچ polymyxa graminis منتقل می شود، یکی از بیماریهای مهم ویروسی جو در جهان است. برای ردیابی سرولوژیکی و مولکولی این ویروس از مزرعه های جو استان خراسان رضوی، شمال شرق ایران، 86 نمونه برگ به صورت تصادفی و یا دارای علایمی شامل موزاییک، زردی و رگبرگ روشنی در اوخر زمستان سال 1400، جمع آوری شدند. نمونه ها پس از انتقال به آزمایشگاه توسط آزمون های سرولوژیکی الایزا و مولکولی واکنش زنجیرهای پلیمراز- ترانسکریپتاز معکوس (rt-pcr) مورد بررسی قرار گرفتند. با استفاده از آغازگرهای اختصاصی baymv طراحی شده، قطعه ای به طول 800 جفت باز مربوط به پروتیین پوششی ویروس تکثیر شد. از بین جدایه های مثبت آزمون rt-pcr، قطعه دی ان ا تکثیر شده مربوط به جدایه بجستان پس از استخراج از ژل، تعیین توالی گردید. توالی دریافتی جدایه بجستان ، baymv پس از تایید صحت با استفاذه از برنامه بلاست، به همراه سایر توالی های پروتیین پوششی baymv موجود در بانک ژن ncbi به وسیله نرم افزارهای dnaman-7 و vector nti مورد واکاوی فیلوژنتیکی قرار گرفت. قطعه تعیین توالی شده جدایه بجستان دارای بیشترین شباهت در سطح نوکلئوتیدی (94.79 درصد) و آمینواسیدی (90.59 درصد) با قطعه مشابه یک جدایه از اروپا بود. این اولین گزارش وقوع baymv از شهرستان بجستان استان خراسان رضوی ایران است.
|
|
کلیدواژه
|
پروتیین پوششی، baymv، elisa، rt-pcr
|
|
آدرس
|
مجتمع آموزش عالی گناباد, دانشکده علوم, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
serological and molecular detection of barley yellow mosaic virus in khorasan razavi province، iran
|
|
|
|
|
Authors
|
gerami nooghabi mohadese
|
|
Abstract
|
yellow mosaic، caused by the barley yellow mosaic virus (baymv)، which is transmitted by the fungal-like organism polymyxa graminis، is one of the most significant viral diseases affecting barley worldwide. to conduct serological and molecular surveillance of this virus in barley fields across khorasan razavi province، northeastern iran، a total of 86 leaf samples were collected in late winter of 2022. these samples were either randomly selected or exhibited symptoms such as mosaic patterns، chlorosis، and vein clearing. upon transfer to the laboratory، the samples were analyzed using serological elisa tests and molecular reverse transcription polymerase chain reaction (rt-pcr) assays. using baymv-specific primers، an 800 base pair fragment corresponding to the viral coat protein was successfully amplified. among the rt-pcr-positive isolates، the amplified dna fragment from the bajestan isolate was extracted from the gel and sequenced. the obtained sequence was verified using the blast program and subjected to phylogenetic analysis alongside other baymv coat protein sequences available in the ncbi genbank database، using dnaman-7 and vector nti software. the sequenced fragment of the bajestan isolate shared the highest nucleotide (94.79%) and amino acid (90.59%) similarity with a corresponding fragment from a european isolate. this study represents the first report of baymv occurrence in bajestan county، khorasan razavi province، iran.
|
|
Keywords
|
baymv ,coat protein ,elisa ,rt-pcr
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|