جایگاه نسب شناسی جدایه استان لرستان ایران ویروس برگ بادبزنی انگور

مقدمه: ویروس برگ بادبزنی(gflv) یک ویروس‌ مهم آلوده کننده انگور در جهان است. مواد و روش‌ها: انگورهای دارای نشانه gflv از حومه شهر خرم‌آباد در استان لرستان ایران،  در بهار 1399 نمونه‌برداری شدند و آزمون rt-pcr جهت تکثیر ژن gflv-cp آنها انجام و محصول واکنش توالی‌یابی شد. یافته‌ها: آغازگرهای اختصاصی توانستند قطعه‌ای به طول bp 1515 مربوط به ژن cp را تکثیر کنند. بر اساس توالی نوکلئوتیدی این قطعه، gflv برای نخستین بار در این منطقه شناسایی شد. تشابه ترادف نوکلئوتیدی این جدایه به میزان 64/95 -14/89 درصد با دیگر جدایه‌های موجود در بانک ژن ncbi تشخیص داده شد. همچنین در درخت نسب شناسی  این جدایه ها بر اساس ناحیه ژنومی cp، جدایه‌های gflv در دو گروه i و ii خوشه‌بندی شدند. جدایه لرستان gflv همراه با جدایه‌های gflv متعلق به ناحیه شمال غربی کشور و جدایه شهر تاکستان در یک زیرشاخه در گروه i قرار گرفتند و جدایه‌های مربوط به سایر کشورها نیز در این گروه در یک زیرشاخه مجزا قرار گرفتند. همچنین جدایه‌های شرق کشور و استان‌های فارس و کهگیلویه و بویراحمد نیز در گروه ii و در زیرشاخه‌های متفاوت قرار گرفتند. نتیجه‌گیری: یافته های این پژوهش‌ بیانگر بومی بودن ویروس، خاستگاه احتمالی آن از ایران و سپس گسترش آن به سایر نقاط دنیا و نیز اثر جدایی جغرافیایی در تکامل gflv می‌باشد. 

1-Phylogenetic status of Grapevine fanleaf virus isolate of Lorestan province of Iran

Pakbaz S, Darvishnia M, Naghavi A (2022) Phylogenetic status of Grapevine fanleaf virus isolate of Lorestan province of Iran. Plant Pathology Science 11(1):1-12.                     Doi: 10.2982/PPS.11.1.1 Introduction: Grapevine fanleaf virus (GFLV) is a major grapevine infecting virus in the world. Materials and Methods: Grapes showing GFLV signs were sampled from the suburbs of the city of Khorramabad in Lorestan Province of Iran in spring 2020 and RT-PCR test was performed to amplify their GFLV-CP gene and the product was sequenced. Results: Specific primers were able to amplify a 1515 bp fragment of the CP gene. Based on the nucleotide sequence of this fragment, GFLV was first identified in this region. The nucleotide sequence similarity of this isolate was detected at 89.14-95.64% with other isolates in the NCBI library. Also, the phylogenetic tree of these isolates, based on the genomic CP region, grouped GFLV isolates into two groups I and II. The Lorestan GFLV isolate was placed in a subgroup in Group I together with GFLV isolates from the northwestern part of Iran and the Takestan isolate, and isolates from other countries were grouped in a separate subgroup of this group. Also in the phylogenetic tree, the Northeast isolates and the Fars and Kohgiloyeh & Boyer-Ahmad province isolates were classified in Group II. Conclusion: The results of this research indicate that the virus is endemic and that its likely origin was in Iran and then spread to other parts of the world. The impact of geographic segregation on the evolution of GFLV can also be deduced.