|
|
مطالعه فیلوژنی و بیان ژن های پلی آمین اکسیداز (pao) در ذرت (zeamays l.)
|
|
|
|
|
نویسنده
|
عابدی امین ,سوهانی محمد مهدی ,شیرزادیان خرم آباد رضا
|
منبع
|
تحقيقات غلات - 1397 - دوره : 8 - شماره : 1 - صفحه:85 -96
|
چکیده
|
پلی آمین ها به وسیله آنزیمهای آمین اکسیداز شامل آمینواکسیدازهای حاوی مس (cupao) و پلی آمین اکسیدازهای (pao) وابسته به fad به صورت اکسیداتیو دآمینه می شوند. شواهد زیادی مبنی بر نقش ضروری پلی آمین اکسیدازها در رشد و نمو گیاهان مانند اندام زایی و پیری و نیز پاسخ به تنش های زیستی و غیرزیستی وجود دارد. در دسترس قرار گرفتن توالی ژنوم ذرت فرصت بسیار مناسبی برای مستندسازی، گروهبندی و نیز مطالعات ژنومیکس مقایسه ای مهیا ساخته است. در این مطالعه از طریق آنالیزهای بیوانفورماتیک، zmpao1تاzmpao9 در ژنوم ذرت شناسایی شد. آنالیز فیلوژنتیک نشان داد که ژنهای zmpao همانند اورتولوگ آنها در آرابیدوپسیس و برنج به سه گروه اصلی تقسیم می شوند. ضمن اینکه ژن های pao ذرت ارتباط تکاملی نزدیک تری با ژن های برنج در مقایسه با آرابیدوپسیس دارند. مطالعه ساختار ژنی نشان داد که تعداد اینترونهای zmpao از صفر تا نه متغیر است و روی چهار کروموزوم از ده کروموزوم ذرت قرارگرفتهاست. مضاعف شدگی تاندوم و سگمنتال موجب افزایش تعداد اعضای خانواده ژنی pao در ذرت شده اند. با استفاده از داده های ریزآرایه در دسترس، پروفایل رونوشتبرداریژن هایzmpao در فرآیندهای رشد و نمو ذرت ارزیابی و نتایج نشان دهنده نقش احتمالی آن ها در تنظیم نمو بود. نتایج این مطالعه اطلاعات پایهای را ارایه کرد که برای مطالعات عملکردی آینده در مورد فعالیت ژن های zmpao در بافت ها، نقش آنها در نمو و نیز در پاسخ به تنش ها مفید و موثر است.
|
کلیدواژه
|
بیوانفورماتیک، تکامل، ساختار ژن، مضاعف شدگی، همولوگ
|
آدرس
|
دانشگاه گیلان, دانشکده علوم کشاورزی, گروه بیوتکنولوژی کشاورزی, ایران, دانشگاه گیلان, دانشکده علوم کشاورزی, گروه بیوتکنولوژی کشاورزی, ایران, دانشگاه گیلان, دانشکده علوم کشاورزی, گروه بیوتکنولوژی کشاورزی, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Phylogenetic and expression analysisof polyamine oxidase (PAO) genes in maize (Zea mays L.)
|
|
|
Authors
|
Abedi Amin ,Sohani Mohammad Mehdi ,Shirzadian Reza
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|