|
|
|
|
توالی نوکلئوتیدی و آنالیز فیلوژنتیکی ژن گلیکوپروتئینی ویروس سپتی سمی هموراژیک ویروسی (vhs) جداشده از ماهیان قزل‌آلای رنگین‌کمان استان چهار محال و بختیاری
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
مومنی حسین ,فدایی فرد فیروز ,ممتاز حسن ,مومنی منوچهر
|
|
منبع
|
زيست شناسي ميكروبي - 1395 - دوره : 5 - شماره : 19 - صفحه:1 -10
|
|
چکیده
|
مقدمه: سپتی سمی هموراژیک ویروسی به‌عنوان جدی‌ترین بیماری ماهی قزل‌آلای رنگین‌کمان درصنعت آبزی‌پروری شناخته شده است. در مطالعۀ حاضر ژن گلیکوپروتئینی ویروس سپتی سمی هموراژیک ویروسی (vhs) شناسایی شد، و تعیین توالی و آنالیز فیلوژنتیکی برخی ویروس‌های جداشده از ماهیان قزل‌آلای رنگین‌کمان کشور انجام شد. مواد و روشها: نمونه‌های مشکوک به بیماری vhs که از مزارع پرورش قزل‌آلای رنگین‌کمان استان چهارمحال و بختیاری جمع‌آوری شده بود با استفاده از آزمون (rt pcr) reverse transcriptase pcr سنجش شد. در این میان هشت نمونه به‌عنوان سویۀ مثبت شناسایی شد. در این تست، ژن گلیکوپروتئینی (g) ویروس ردیابی گردید و جهت تعیین ردیف نوکلئوتیدی تعیین توالی شد. نتایج حاصل از مقایسۀ ردیف نوکلئوتیدی تعیین‌شده در این مطالعه با توالی شناخته‌شدۀ ژن گلیکوپرتئینی سایر ویروس‌ها مطالعۀ فیلوژنتیکی شد. نتایج: نتایج حاصل از مطالعۀ حاضر نشان داد که بین صفر تا 4/7 درصد تنوع ژنتیکی در ژن گلیکوپروتئینی وجود دارد و در این میان بیشترین قرابت با ردیف نوکلئوتیدی ژن گلیکوپروتئینی درآلمان (توالی eu708818) با 100درصد تشابه و کمترین قرابت مربوط به جدایه‌های این ویروس در ژاپن (توالی ab672616) و ترکیه (توالیjf415091) هر کدام با 60/92 درصد قرابت مشاهده شد. بحث و نتیجهگیری: با توجه به قرابت ژنتیکی ویروس‌های vhs جداشده از ایران با سویه‌های اروپائی به‌ویژه آلمان و فرانسه احتمال وجود ارتباط بین شیوع بیماری vhs ایران و تخم‌های چشم‌زدۀ وارداتی از کشورهای ذکرشده وجود دارد.
|
|
کلیدواژه
|
ژن گلیکوپروتئینی(g)، ویروس vhs، آنالیز فیلوژنتیکی، rt-pcr
|
|
آدرس
|
دانشگاه آزاد اسلامی واحد شهرکرد, باشگاه پژوهشگران جوان و نخبگان, ایران, دانشگاه آزاد اسلامی واحد شهرکرد, ایران, دانشگاه آزاد اسلامی واحد شهرکرد, ایران, دانشگاه آزاد اسلامی واحد شهرکرد, باشگاه پژوهشگران جوان و نخبگان, ایران
|
|
پست الکترونیکی
|
momeniman@yahoo.com
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Nucleotide sequencing and phylogenetic analysis of glycoprotein gene of viral hemorrhagic septicemia virus (VHSV) isolated from rainbow trout in Chaharmahal and Bakhtiary province
|
|
|
|
|
Authors
|
Momeni Hosein ,Fadaeifard Firooz ,Momtaz Hasan ,Momeni Manoochehr
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|