جداسازی و شناسایی میکسوباکتر تولیدکنندۀ myxovirescins،myxalamides و myxochromids از دستگاه گوارش کرم خاکی منطقۀ قائم‌شهر

مقدمه: میکسوباکترها باکتری‌های گرم منفی متعلق به گروه دلتا‌پروتئوباکترها با سلول‌های رویشی میله‌ای‌شکل و ارگانوتروف هستند که رفتار گروهی منحصر‌به‌فردی را نشان می‌دهند و در دستۀ باکتری‌های خاک قرار می‌گیرند.مواد و روش‏‏ها: جدایۀ میکسوباکتریایی mx18zk از اندام گوارشی کرم خاکی منطقۀ قائم‌شهر مازندران جداسازی شد. به‌منظور بررسی فعالیت زیستی باکتری استخراج حلالی محیط‌کشت انجام و عصارۀ متانولی حاصل برای بررسی فعالیت زیستی علیه یازده نوع بیماری‌زای مختلف انسانی به روش رقت‌سازی در میکروپلیت بررسی شد. درنهایت، باقیماندۀ عصارۀ متانولی به‌وسیلۀ hplc فراکسیون‌گیری و دوباره علیه بیماری‌زاهای حساس آزمون شد.نتایج: جدایۀ mx18zk فعالیت ضد‌میکروبی درخور توجهی علیه باکتری‌های شاخص staphylococcus aureus، escherichia coliوchromobacterium violaceum نشان داد. بررسی ویژگی‌های ریخت‌شناسی، بیوشیمیایی، توالی ژن 16s rdna و درخت فیلوژنی باکتری نشان داد این جدایه با 100 درصد همولوژی به گونۀ corallococcus macrosporus تعلق دارد. عصاره‌های فعال با دستگاه lc/msمطالعه شدند و نتایج آنها با متابولیت‌های ثانویۀ میکسوباکتریایی شناخته‌شدۀ موجود در بانک اطلاعاتی myxobase مرکز hzi مقایسه شدند. تجزیه‌وتحلیل lc/msعصارۀ متانولی محیط‌کشت نشان‌دهندۀ حضور یون مولکولی آنتی‌بیوتیک‌های میکسوکرومید و همچنین میکسوویریسین و میکسالامید گزارش‌نشده در این گونه بود.بحث و نتیجه‏گیری: بر اساس نتایج مشاهده‌شده سویۀ جداسازی‌شدهفعالیت ضدمیکروبی علیه باکتری‌های شاخص staphylococcus aureus،  escherichia coliو chromobacterium violaceum نشان داد و با 100 درصد همولوژی به گونۀ macrosporuscorallococcus تعلق داشت. تجزیه‌وتحلیل lc/msنشان‌دهندۀ حضور آنتی‌بیوتیک‌های گزارش‌نشدۀ میکسوویریسین و میکسالامید و همچنین میکسوکرومید شناخته‌شده در این گونه بود.

Isolation and Identification of a Myxobacterium Producing Myxovirescins, Myxalamides and Myxochromids from Intestinal Tract of earth Worm of Ghaemshahr County

Introduction: Myxobacteria are Gramnegative Deltaproteobacteria with rodshaped vegetative cells, aerobic organotrophs that exhibit unique group behavior. Materials and Methods:The myxobacterial strain Mx18Zk was isolated from intestinal tract of earth worm of GhaemshahrCounty in Mazandaranprovince and the extraction of the fermented broth culture was prepared with organic solvent extraction method. Methanol extract tested for potential antimicrobial activity against11 various human pathogens. Finally the rest of methanol extract fractionated by HPLC and tested again against sensitive pathogens.Results: Strain Mx18Zk significantly inhibited growth of Escherichia coli, Staphylococcus aureus and Chromobacterium violaceum, therefore was used for further characterization. Analysis of morphological, biochemical, 16S rRNA gene sequence and phylogenetic tree indicated that this strain with 100 % homology belongs to the genus Corallococcus macrosporus . The methanol extract was subjected to HPLC fractionation against sensitive pathogens. The active extracts studied by LCMS and its results compared by previously identified myxobacterial secondary metabolites deposited in Myxobase database of HZI. LC/MS analysis resulted in the identification of Myxochromids and unknown Myxovirescins, Myxalamides antibiotics in methanol extract of the strain Mx18Zk.Discussion and conclusion: On the basis of results, isolated strain was active against Escherichia coli, Staphylococcus aureus and Chromobacterium violaceum and100 % homology was belong to the genus Corallococcus macrosporus. LC/MS analysis resulted in the identification of Myxochromids and unknown Myxovirescins, Myxalamides antibiotics in methanol extract of the strain Mx18Zk.