ردیابی و تعیین خصوصیات ملکولی ویروئید فرورفتگی میوه سیب(apple dimple viroid) در منطقه مراغه
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
رومی وحید
|
|
منبع
|
پژوهش هاي كاربردي در گياه پزشكي - 1397 - دوره : 7 - شماره : 2 - صفحه:107 -119
|
|
چکیده
|
در تابستان سال های 1395 و 1396 تعداد 73 نمونه با علائم مشابه با ویروئید فرورفتگی میوه سیب از ارقام گالا و رد دلیشیز منطقه ی مراغه جمع آوری شد. rna کل از پوست ساقه و برگ نمونه های جمع آوری شده حاوی علایم لکه های فرورفته و خال های زرد با حاشیه نامنظم روی پوست میوه، استخراج گردید و با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ژنوم کامل ویروئید به طول 307-306 جفت باز با آزمون rt-pcr تکثیر و ترادف 10 نمونه تعیین گردید. جستجوی ترادف ها با blastn و هم ردیف سازی آنها با ترادف های مربوطه در بانک ژن نشان داد که جدایه های مورد مطالعه دارای بیشترین و کمترین یکسانی ترادف به میزان 100 و 74/4 درصد بترتیب با رس شمارهای ef088662 (ایتالیا) و kf788291 (ایتالیا) می باشند. بیشترین تفاوت نوکلئوتیدی در بین نواحی ccrو tr قرار داشتند. آنالیز فیلوژنتیک با روش حداکثر احتمال نشان داد که جدایه های ایرانی به همراه جدایه ها و واریانت های گزارش شده از ایتالیا در یک گروه قرار می گیرند.
|
|
کلیدواژه
|
ردیابی، ویروئید، فرورفتگی میوه، سیب، ایران
|
|
آدرس
|
دانشگاه مراغه, دانشکده کشاورزی, گروه گیاهپزشکی, ایران
|
|
پست الکترونیکی
|
vroumi@maragheh.ac.ir
|
|
|
|
|
|
|