شناسایی مناطق ژنومی تحت انتخاب مثبت کنترل کننده صفات ساختاری بدن در نژادهای مختلف بز

هدف از این پژوهش، شناسایی مناطق ژنومی تحت انتخاب مرتبط با صفات ساختاری بدن در نژادهای مختلف بز بود. بدین منظور، از اطلاعات ژنوتیپی 728 راس بزهای غیرخویشاوند متعلق به چهار نژاد مختلف تعیین ژنوتیپ شده با آرایه های 50k استفاده شد. جهت شناسایی نواحی ژنومی تحت انتخاب از دو آزمون آماری برآوردگر نااریب fst (تتا) و hapflk استفاده شد. نتایج حاصل از آماره تتا منجر به شناسایی هشت ناحیه ژنومی روی کروموزوم های شماره 3، 4، 7، 13، 15، 18، 20 و 29 شد. ژن های کاندیدای شناسایی شده مرتبط با صفات ساختاری شامل ژن های tgfbr3، calcr، acad8، bcar1 و adamts6  بودند و عملکردهای متفاوتی شامل رشد و توسعه عضلات اسکلتی، طول بدن، تنظیم کانال کلسیمی، هموستازی الیاف ماهیچه ای، میزان خوراک مصرفی، ساخت پروتئین و اندازه سلول ماهیچه ای داشتند. به علاوه، بررسی qtlهای گزارش شده در مناطق انتخابی و اورتولوگوس گاوی، قرار داشتن qtlهای مرتبط با افزایش وزن بدن، عرض کپل و وزن متابولیکی بدن را نشان داد. همچنین، نتایج حاصل از آماره hapflk در این پژوهش، منجر به شناسایی پنج ناحیه ژنومی روی کروموزوم های شماره 1، 5، 6، 13 و 30 شد. ژن های کاندیدای شناسایی شده در این مناطق ژنومی شامل fndc3b، stab2 و ccny بودند و عملکردهای متفاوتی در تکثیر فیبروبلاست ها و تمایز سلول های استخوانی داشتند. ژن هایی که در نواحی ژنومی شناسایی شدند، می توانند بر اساس عملکرد به عنوان کاندیداهای تحت انتخاب مثبت مطرح باشند. در هر حال، نیاز به بررسی های پیوستگی و عملکردی بیشتری جهت شناسایی عملکرد ژن ها وجود دارد. استفاده از یافته های این تحقیق می تواند باعث تسریع در پیشرفت ژنتیکی برنامه های اصلاح نژادی بز شود.

identification of genomic regions under positive selection that control the type traits in different goat breeds

introduction: molecular markers that reveal polymorphisms at the dna level now play a key role in animal genetics. however, the selection of molecular markers is crucial depending on the purpose, viz. this depends on different molecular biology techniques and their effects. over the last decade, interest in identifying genes or genomic regions targeted by selection has grown. identifying selection signatures can provide valuable insights into the genes or genomic regions that are or have been under selection pressure, which in turn leads to a better understanding of genotype-phenotype relationships. type characteristics are important for breed identification and classification and are also positively correlated with body weight. this study aimed to identify effective genes and genomic regions under positive selection signatures in different goat breeds using selection signature methods.