|
|
|
|
شناسایی ژن‌های متفاوت بیان شده در جوجه‌های آلوده به ویروس h5n1 با استفاده از فراتحلیل داده‌های ریزآرایه dna
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
صالحی نسب مونا ,رحیمی میانجی قدرت الله ,ابراهیمی اسماعیل ,غفوری علی
|
|
منبع
|
تحقيقات توليدات دامي - 1397 - دوره : 7 - شماره : 3 - صفحه:13 -23
|
|
چکیده
|
پیدا کردن نیم‌رخ بیان ژنی در طول سال های اخیر، منجر به شناسایی ژن های خاص در پاسخ به بیماری های گوناگون شده است. یکی از این بیماری های مهم در صنعت طیور، بیماری آنفولانزا است. هدف از پژوهش حاضر، شناسایی ژن های موثر در بروز آنفولانزای ناشی از ویروس h5n1 با استفاده از فرا تحلیل دو مجموعه داده ریزآرایه dna که بیان ژن های میزبان در پاسخ به آنفولانزا را مورد بررسی قرار داده بودند، بود. فراتحلیل نشان داد که ژن های stk17b، ccl4، mcm9، irf7 و il6 با روش های fisher، aw و maxp متمایز بیان می‌شوند. برای تایید تمایز بیان ژن های شناسایی شده در آزمایشگاه از realtime pcr استفاده شد. بدین منظور از نمونه هایی استفاده شد که پیش تر با ویروس h5n1 چالش داده شده بودند. نتایج برای هر پنج ژن انتخابی، تمایز بیان آنها را در حالت مواجهه با آلودگی و حتی جهت تنظیمی بیان را که در فرا تحلیل مشاهده شده بود، در سطوح معنی دار تایید نمود، به گونه ای که ژن های il6، irf7 و ccl4 افزایش بیان و ژن های stk17b و mcm9 کاهش بیان نشان دادند. این نتایج پیشنهاد می دهند فرا تحلیل روشی بسیار قوی در شناسایی ژن هایی است که ممکن است در پژوهش های انفرادی مورد توجه قرار نگیرند. این ژن ها ممکن است نقش حیاتی در تنظیم پاسخ میزبان ایفا نمایند.
|
|
کلیدواژه
|
آنفولانزای پرندگان، پاسخ میزبان، پی سی آر کمّی، تمایز بیان، فراتحلیل
|
|
آدرس
|
دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری, ایران, دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری, ایران, دانشگاه شیراز, پژوهشکده بیوتکنولوژی, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Identification of differentially expressed genes in H5N1 infected chickens using metaanalysis of DNA microarray datasets
|
|
|
|
|
Authors
|
Salehinasab M. ,Rahimi Mianji Gh. ,Ebrahimie E. ,Ghafouri S. A.
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|