ارزیابی تنوع ژنتیکی توده‌های گیاه دارویی نائین هاوندی بر اساس نشانگرهای پروتئینی و srap

در این پژوهش، تنوع ژنتیکی 10 توده مختلف نائین هاوندی با استفاده از نشانگرهای پروتئینی و srap مورد بررسی قرار گرفت. در مرحله رویشی گیاه از برگ‌ها، پروتئین و dna استخراج شد. نتایج پروفایل پروتئینی در مجموع 20 نوار با 64.15 درصد چندشکلی نشان داد. برای ارزیابی تنوع ژنتیکی در سطح dna، 6 ترکیب آغازگری srap مورد استفاده قرار گرفت که در مجموع 583 نوار قابل امتیازدهی مشاهده شد. تعداد 549 نوار آن دارای چندشکلی با میانگین 91.5 برای ترکیبات آغازگری مورد بررسی بود. بیشترین چندشکلی (99.12 درصد) در ترکیب آغازگری e1/m1 و کمترین چندشکلی (84.21 درصد) در ترکیب e2/m2 مشاهده شد. آنالیز خوشه ای، توده ها را در 4 گروه اصلی طبقه بندی نمود. شاخص های تنوع ژنتیکی برای تمام مکان های ژنی از جمله میانگین تنوع ژنتیکی نی (h)با مقدار 0.27 و میانگین شاخص شانون (i)با مقدار 0.41 محاسبه شد. سطح بالایی از تمایز جمعیت (0.79=gst) و سطح مناسبی از جریان ژنی (1.3=nm) بین جمعیت های گروه بندی شده برآورد شد. تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که واریانس درون جمعیتی (58%) بیشتر از واریانس میان جمعیت ها (42%) است. به طور کلی نتایج مطالعه حاضر، تنوع ژنتیکی بالایی هم در الگوی الکتروفورگرام پروتئین و هم در نوارهای چندشکل تفکیک شده با استفاده از نشانگرهای srap با تاکید بر کارآیی بیشتر نشانگرهای srap نسبت به نشانگر پروتئین نشان داد که می تواند در انتخاب والدین با فاصله ژنتیکی زیاد جهت تولید جمعیت‌های در حال تفرق و نقشه‌یابی در برنامه های دورگ گیری و به نژادی یا بهبود صفات مطلوب و همچنین، برای محافظت و مدیریت ژرمپلاسم این گیاه استفاده شود.

assessment of the genetic diversity among nain-e havandi medicinal plant accessions based on protein and srap markers

in this study, the genetic diversity of 10 different accessions of andrographis paniculata was investigated using protein and srap markers. in the vegetative stage, protein and dna were extracted from the leaves. the results of protein profile indicated a total of 20 bands with 64.15% polymorphism. to evaluate genetic diversity at the dna level, 6 srap primers were used and a total of 583 scalable bands were observed. a total of 549 bands had polymorphism with an average of 91.5 for the studied primers. the highest polymorphism (99.12%) and the lowest polymorphism (84.21%) were observed in e1/m1 e2/m2 primers, respectively. cluster analysis produced four main clusters. genetic diversity indices were calculated for all gene loci, including the average genetic diversity of nei’s (0.27) and the mean of shannon’s index with a value of 0.41. high level of population differentiation (gst = 0.79) and good level of gene flow (nm = 1.3) were estimated between the grouped populations. molecular analysis of variance showed that intra-population variance (58%) was higher than inter-population variance (42%). overall, the results of study showed a high genetic diversity in both protein electrophoresis pattern and in polymorphic bands separated using srap markers with emphasis on the greater efficiency of srap markers than protein markers, which can be selected in parents with genetic distance. it is widely used to produce dispersing and mapping populations in hybridization programs and to breed or improve desirable traits, as well as to protect and manage the germplasm of this plant.