شناسایی مولکولی توده‌های بذری با استفاده از نمونه‌های بالک بذر: مطالعه موردی بر روی توده‌های بذری گیاه یونجه زراعی

ایران یکی از مهم ترین مراکز تنوع ژنتیکی گیاه یونجه در جهان می‌باشد و انواع مختلفی از آن در کشور وجود دارد. تایید اصالت توده‌ها و ارقام یونجه از این لحاظ که تنوع ژنتیکی در این گیاه می‌تواند تاثیر مستقیمی بر عملکرد و کیفیت علوفه و بذر داشته باشد، از اهمیت ویژه‌ای برای کشاورزان و تولیدکنندگان بذر برخوردار است. در این راستا در مطالعه حاضر، توسعه روشی برای شناسایی و تفکیک مهمترین توده‌های یونجه زراعی ایران به وسیله نشانگرهای ریزماهواره مورد توجه قرار گرفت. به منظور تسهیل تمایز و تفکیک توده‌های یونجه مورد نظر، آلل‌های اختصاصی و یا به عبارت بهتر ژنوتیپ آللی اختصاصی برای هر توده شناسایی گردید. بدین منظور از نمونه‌های تصادفی حاوی 100 بذر از هر توده استفاده گردید که در نهایت از طریق 9 جایگاه ریزماهواره با استفاده از ژنوتیپ آللی اختصاصی شناسایی شده برای هر توده به وضوح تفکیک شدند. بیشترین قابلیت تفکیک متعلق به نشانگرهای mtic233، ‌bi90، act009، tc7، mtic183، ms30، mtic238 و afca11 ‌بود. دورترین فاصله ژنتیکی مربوط به توده‌های 5-b و خارجی و هم چنین توده‌های 29-n و خارجی و نزدیک ترین فاصله مربوط به توده های 27-g، 9-h و 21-r بود. با توجه به نتایج حاصل به نظر می‌رسد توده‌های 9-h، 21-r، 27-g، 25-b، 5-b و 2-g دارای زمینه ژنتیکی مشترک و با شباهت بیشتری نسبت به بقیه توده‌ها می‌باشند. روش پیشنهادی در این مطالعه به سادگی و در مدت کوتاه (یک تا دو روز) امکان شناسایی توده یونجه مورد نظر را بدون نیاز به استخراج dna از برگ فراهم می‌نماید.

molecular identification of seed accessions using bulk seed samples: a case study on alfalfa

iran stands out as a significant center of genetic diversity for alfalfa (medicago sativa) worldwide, harboring diverse types of this plant. ensuring the authenticity of alfalfa populations and varieties is crucial for farmers and seed producers, as the genetic makeup of this species directly influences forage and seed yield quality. in this study, we developed a method to identify and differentiate key iranian cultivated alfalfa populations using microsatellite markers. we collected random samples, each containing 100 seeds, from various alfalfa accessions. nine microsatellite loci were screened and employed to differentiate these populations based on specific allelic genotypes. notably, the mtic233, bi90, act009, tc7, mtic183, ms30, mtic238, and afca11 markers exhibited the highest differentiation ability. the genetic distance analysis revealed that 5-b and foreign accessions, as well as 29-n and foreign accessions, were the most distant from each other. conversely, 27-g, 9-h, and 21-r exhibited the closest genetic similarity. the results revealed that, accessions 9-h, 21-r, 27-g, 25-b, 5-b, and 2-g shared a common genetic background, suggesting their close relatedness. our proposed method allows straightforward identification of target alfalfa accessions within a short timeframe (one to two days) without the need for dna extraction from leaves.