pirnaهای دارای افتراق بیان در سلول های سرطان سینه

سرطان سینه شایع‌ترین سرطان زنان می‌باشد که علیرغم پیشرفتهای علمی زیاد همچنان علت اصلی مرگ و میر ناشی از سرطان در بین زنان محسوب می‌شود. برای حل این معضل جهانی نیازمند مطالعات مولکولی عمیق‌تری در حوزه سرطان سینه هستیم. امروزه نقش pirnaها بعنوان تنظیم کننده بیان ژن‌ها در سرطان‌های مختلف مورد توجه بسیاری قرار گرفته است. در این مطالعه هدف ما شناسایی pirnaهای مهم درگیر در سرطان سینه و ژن‌های هدف آن‌ها می‌باشد. برای این منظور داده‌های rna seq small خام مربوط به نمونه‌های بافت سرطان سینه و بافت نرمال سینه از پایگاه داده geo انتخاب و استخراج شد و از پلتفرم galaxy برای آنالیز بیوانفورماتیکی آن‌ها استفاده شد. بیان افتراقی 372 عدد pirna بر اساس log2 fc ≥ 2، p. value ≤ 0.05 بدست آمد که 191 عدد افزایش بیان و 181 عدد کاهش بیان معنی‌دار را نشان دادند. بیشترین افزایش مربوط به hsa-pir-33125 می‌باشد که هدف آن gatad2a می‌باشد و در پروسه های سرطانزایی از قبیل توسعه عروق خونی، آپاپتوز، تنظیم بیان ژن در سطح رونویسی و ... نقش دارد. بیشترین کاهش مربوط به hsa-pir-33073 با log2 fc= -4.20 می‌باشد. پیدا کردن لیستی از pirnaهای مهم که افتراق بیان معنی‌دار در سرطان سینه نسبت به بافت نرمال دارند و همچنین مشخص کردن افزایش و یا کاهش بیان آن‌ها در بافت سرطانی و تشخیص ژن‌های هدف و بررسی نقش آن‌ها در مسیرهای بیولوژیکی دخیل در توسعه و پیشرفت سرطان، می‌تواند آغازگر مطالعاتی باشد که در نهایت منجر به پیشرفت‌ در تحقیقات سرطان سینه و روش‌های درمانی شود.

differentially expressed pirnas in breast cancer cells

breast cancer is the most common cancer in women, and despite many scientific advances, it remains the leading cause of cancer-related death in women. to solve this global problem, deeper molecular studies in the field of breast cancer are needed. nowadays, the role of pirnas in various cancers is of great interest. in this study, we aim to identify important pirnas involved in breast cancer. for this purpose, raw small rna seq data related to cancerous and normal breast tissue samples were selected and extracted from the geo database, and the galaxy platform was used for their bioinformatic analysis. the differential expression of 372 pirnas was obtained based on log2 fc ≥ 2, p-value ≤ 0.05, of which 191 showed increased expression and 181 showed decreased expression. the highest increase is related to hsa-pir-33125, whose target is gatad2a and plays a role in carcinogenesis processes such as blood vessel development, apoptosis, regulation of gene expression at the transcriptional level, etc. the largest decrease is related to hsa-pir-33073 with log2 fc= -4.20. to find a list of important pirnas that have a significant difference in expression in breast cancer compared to normal tissue, as well as to determine the increase or decrease of their expression in cancer tissue and to identify the target genes and investigate their role in the biological pathways involved in the development and progression of cancer. this can be the beginning of studies that will ultimately lead to advances in breast cancer research and treatment methods.