بررسی بیوانفورماتیکی تاثیر لیکوپن روی بیان پروتئین های شوک حرارتی (hsp27) در سرطان پروستات

در بیشتر سرطان ها سطح بیان پروتئین های شوک حرارتی بالا می رود که سلول های سرطانی را نسبت به دارو درمانی مقاوم و موجب پیش آگهی ضعیف می گردد. همچنین ارتباط آنها با تکثیر سلولی، تهاجم و متاستاز مشخص شده است. لیکوپن به عنوان یک کارتنوئید از آنتی اکسیدانت های موثر است که برای جلوگیری از رشد غده های سرطانی کار برد دارد. پروستات یکی ازشایع ترین سرطان هایی است که در مردان دیده می شود. برای درمان این بیماری بیشتراز جراحی و شیمی درمانی استفاده می گردد که عوارض متعدد بعد از درمان و هزینه بر است. برای این مطالعه داده های خام ریز آرایه سرطان پروستات تحت تیمار لیکوپن و غیر تیمار با حجم بالا از پایگاه ncbi بخش geoدریافت شد. سپس تغییرات بیان پروتئین های شوک حرارتی(hsp27) با استفاده از ابزارها و روش های بیوانفورماتیکی، تعیین گردید و مقایسه نتایج سطح بیان ژن های تیمار با لیکوپن نسبت به غیر تیمار مشخص نمود که سطح بیان نسبی ژن hspb8 به شدت کاهش یافته و همچنین تغییرات قابل ملاحظه ای در سطح بیان سایر واریانت های این ژن مشاهده نشد. این نتایج نشان می دهد که لیکوپن می تواند درسلولهای سرطانی پروستات تنش ایجاد کند و با این عمل سلولهای سرطانی را به طرف آپویتوز هدایت کند.

bioinformatics investigation of the effect of lycopene on the expression of heat shock proteins (hsp27) in prostate cancer

in most cancers, the expression level of heat shock proteins is increased, which makes cancer cells resistant to drug therapy and has a poor prognosis. they have also been linked to cell proliferation, invasion and metastasis. lycopene, as a carotenoid, is an effective antioxidant used to prevent the growth of cancerous glands. prostate cancer is one of the most common cancers seen in men. to treat this disease, surgery and chemotherapy are mostly used, which have many complications after treatment and are costly. in this study, prostate cancer was treated with lycopene and raw microarray big data were received from geo section of ncbi database. then, the expression changes of heat shock proteins (hsp27) were determined using bioinformatics tools and methods, and comparing the expression levels of lycopene-treated genes with non-treated ones showed that the expression level of hspb8 gene was drastically reduced and also, no significant changes were observed in the expression level of other gene families in this group. results show that lycopene can cause stress in cancer cells and this stress predisposes the cell to apoptosis.