کاربرد نشانگر issr جهت ارزیابی تنوع ژنتیکی بین و درون گونه‌ای چاودار

چاودار یکی از گیاهان زراعی مهم ایران با نام علمی secaleمتعلق به خانواده گندمیان (poaceae) می باشد. در این پژوهش تنوع ژنتیکی 39 جمعیت چاودار از مناطق مختلف ایران، آمریکا و شوروی با نشانگر issr مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج بدست آمده نشان داد که 8 آغازگر issr 48 باند تولید کردند که شامل 18 باند چندشکل (37.5 درصد چندشکلی) بود. میانگین میزان اطلاعات چندشکلی (pic) 0.15 و شاخص نشانگر (mi) در آغازگرهای issr معادل 2.7 عدد بود. بیشترین مقدار pic (0.3) مربوط به آغازگر 6+5 و بیشترین mi (0.96) مربوط به آغازگر 6+1 بود. پس از مشاهده محصول های واکنش زنجیره ای پلیمراز بر روی ژل آگارز و امتیازدهی باندهای dna، تجزیه و تحلیل با نرم افزار ntsys انجام شد. دندروگرام تجزیه خوشه ای با روش upgma و ضریب تشابه جاکارد جمعیت های چاودار را به 9 گروه تقسیم کرد که نتایج گروه بندی آن با گروه بندی تجزیه مولفه های اصلی مطابقت داشت. نتایج تجزیه واریانس مولکولی بیانگر تنوع درون گونه ای بیشتر از تنوع بین گونه ای بود. میانگین تنوع ژنی نی (h) 0.350 و میانگین شاخص شانون (i) در گونه های چاودار 0.523 بود که بیانگر تنوع خوب درون گونه ها می باشد. نتایج نشان داد که نشانگر issr ابزار مفیدی در تعیین تنوع ژنتیکی درون و بین گونه ای چاودار است.

Using of ISSR Marker in Assessment of Genetic Diversity Inter and Intra Specific of Rye

Rye is one of Iran #39;s most important crops, known as Secale, belonging to the Poaceae. In this research, genetic diversity of 39 families of rye populations from different regions of Iran, the USA, and the Soviet :union: was evaluated with the ISSR marker. The results showed that 8 ISSR initiators produced 48 bands which included 18 polymorphic bands (37.5% polymorphism). The mean of polymorphic information content (PIC) and marker index value (MI) for ISSR primers was 0.15 and 7.2 respectively. The highest PIC (3.0) was related to primer 5+6 and the highest MI (0.96) reached for primer 1+6. After observing polymerase chain reaction products on an agarose gel and scoring DNA bands, the analysis was performed with NTSYS software. The cluster analysis dendrogram of UPGMA and Jaccard #39;s similarity coefficient divided the rye populations into 9 groups, the results were compiled with grouping by principal component analysis. The results of analysis of Molecular Variance indicated an inspecies variation more than interspecies variation. The mean Nei genetic variation (h) was 350 and the mean of Shannon index (I) in rye species was 523, which indicates a relatively good variety within species. The results showed that the ISSR marker was a useful tool in determining genetic variation of inter and intra specific of rye.