مقایسه کارآیی نانوذرات مغناطیسی آهن با روش‌های ctab و تشخیص سریع برای استخراج dna از گلبرگ گل سرخ رقم vendetta

استخراج dna با کیفیت و کمیت عالی برای بسیاری از مطالعات بیولوژی مولکولی ضروری است. dna استخراج‌شده از بافت گلبرگ به خاطر محتوای فراوان متابولیت‌ های ثانویه از کمیت و کیفیت مطلوبی برخوردار نیست. کاروتنوئیدها، آنتوسیانین‌ها، فنولیک‌اسیدها و فلاونوئیدها، موثرترین متابولیت‌های ثانویه موجود در گلبرگ به‌عنوان آلودگی در نظر گرفته می‌شوند و در فرآیند استخراج و تخلیص dna اختلال ایجاد می‌نمایند. با توجه به این که مبنای بسیاری از تحقیقات مولکولی در مهندسی ژنتیک و ژنومیکس، وجود dna با کیفیت بالا است، بنابراین یافتن روشی کارآمد برای کاهش اثرات منفی این ترکیبات در فرآیند استخراج ضروری به نظر می‌رسد. در همین راستا نانوذرات مغناطیسی آهن برای بهبود استخراج dna با کمیت و کیفیت عالی از بافت گلبرگ گل سرخ در این پژوهش استفاده شده است. در ادامه به‌منظور مقایسه کارآیی استخراج dna، از روش‌های ستیل‌تری‌‌متیل‌اتیل‌آمونیوم‌بروماید (ctab) بهینه شده و روش تشخیص سریع استفاده شد. نتایج نشان داد که کمیت و کیفیت dna استخراج‌شده از گلبرگ با استفاده از روش نانوذرات مغناطیسی آهن در مقایسه با دو روش دیگر قابل اعتمادتر بود. علاوه براین، این روش قادر به استخراج مقدار مطلوب dna، با کمترین میزان نمونه در طی چند دقیقه است. با توجه به کیفیت وکمیت dna استخراج‌شده با نانوذرات مغناطیسی آهن، این روش به‌عنوان یک پروتکل کارآمد برای استخراج dna از گلبرگ گل سرخ توصیه می‌شود.

Comparison of the Efficiency of Iron-Magnetic Nanoparticles with CTAB and Rapid Detection Methods for DNA Extraction of Rose petal (Rosa hybrida L. cv. Vendetta)

The high quality and quantity of extracted DNA is necessary for a variety of molecular biology studies. Low yields and poor quality of genomic DNA extracted from petal due to high levels of secondary metabolites. Carotenoids, anthocyanins, phenolic acids and flavonoids are the most effective secondary metabolites in petals, which are considered as contaminating compounds and could lead to interfere with DNA during extraction and purification. Considering that the basis of the most molecular research in genetic engineering and genomics is highquality of DNA, therefore, it seems that finding an efficient method for reducing adverse effects of these contaminating compounds for the exteraction is essential. In this regard, ironmagnetic nanoparticles have been used to improve the exteraction of high yields and quality of DNA from rose petals in the present work. In the following, to compare the efficiency of DNA extraction, modified CTAB (Cetyl Trimethyl Ammonium Bromide) and rapid detection methods were used. The results showed that petal rsquo;s extracted DNA quantification and qualification by ironmagnetic nanoparticles procedure was much more reliable than two other methods. Inaddition, this method could extract optimal amount of DNA with the lowest amounts of samples within few minutes. Due to high qualification and quantification of DNA purification by ironmagnetic nanoparticles, the present procedure could be recommended as an efficient protocol for rose petal DNA extraction.