|
|
دادهکاوی بهعنوان ابزاری برای شناخت mirnaهای تنظیمکننده بنیادینگی، متاستاز و مقاومت به دارو در سرطان معده
|
|
|
|
|
نویسنده
|
عظیمی مهناز ,رحیمی مهسا ,ابراهیمی مرضیه ,توتونچی مهدی
|
منبع
|
زيست فناوري - 1398 - دوره : 10 - شماره : 2 - صفحه:255 -261
|
چکیده
|
سرطان معده پنجمین سرطان شایع در جهان است. به نظر می رسد که سلول های بنیادی واقع در تومور از خاصیت جاودانگی برخوردار بوده و مسئول مقاومت به درمان، بازگشت تومور و متاستاز باشند. امروزه مشخص شده است که mirnaها که از دسته rnaهای کوچک غیرکدکننده هستند نقش مهمی در تنظیم فعالیت سلول lrm;های بنیادی سرطان دارند. بنابراین هدف مطالعه مروری حاضر، معرفی mirnaهایی است که در تنظیم هر سه خصوصیت بنیادینگی، متاستاز و مقاومت به دارو دخیل هستند. با شناسایی این mirnaها، می توان از آنها به عنوان نشانگرهای زیستی در تشخیص و هدف گیری به منظور درمان هرچه بهتر سرطان بهره برد. در این مطالعه با استفاده از مرور سیستماتیکی و داده کاوی، هفت mirna شامل mir100، mir107، mir19b، mir30a، mir27a، mir23a و mir34a به دست آمد که قادر به تنظیم هر سه مسیر بنیادینگی، متاستاز و مقاومت به دارو در سرطان معده بودند و همچنین 52 عدد ژن هدف به دست آمد که از مهم ترین ژن های آن می توان به axl، cd24، cd44، sirt1، notch2، notch1، cdk6 و myc اشاره کرد که در تنظیم چندین فرآیند زیستی دخالت دارند.
|
کلیدواژه
|
سرطان معده، متاستاز، سلول بنیادی، مقاومت به دارو
|
آدرس
|
جهاد دانشگاهی, پژوهشکده زیستشناسی و فناوری سلولهای بنیادی, پژوهشگاه علوم سلولی (رویان), ایران, جهاد دانشگاهی, پژوهشکده زیستشناسی و فناوری سلولهای بنیادی, پژوهشگاه علوم سلولی (رویان), ایران, جهاد دانشگاهی, پژوهشکده زیستشناسی و فناوری سلولهای بنیادی, پژوهشگاه علوم سلولی (رویان), ایران, جهاد دانشگاهی, پژوهشکده زیستشناسی و فناوری سلولهای بنیادی, گروه ژنتیک و زیست پزشکی تولید مثل, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Data Mining as a Tool to Identify miRNAs which Regulate Stemness, Metastasis and Drug Resistance in Gastric Cancer
|
|
|
Authors
|
Azimi M. ,Rahimi M. ,Ebrahimi M. ,Totonchi M.
|
Abstract
|
Cancer stem cells are responsible for the formation the resistance to treatment, tumor relapse, and metastasis. miRNAs play an important role in the regulation of biological processes. Therefore, the purpose of this review is to candidate miRNAs that are involved in the regulation of all three properties including stemness, metastasis, and drug resistance and find their target genes and signaling pathways by using literature learning and data mining. The present systematic review is done to identify stemnessregulating miRNAs. By using CORMINE database, metastasis and drug resistance regulating miRNAs collected. Finally, we compared these three lists of miRNAs and found common miRNAs in these three properties. ONCO.IO database and KEGG pathway have been done to obtain the interaction between miRNAmiRNA target and cancerrelated signaling pathway respectively. We collected 191 stemnessregulating miRNAs from 21 excluded studies. Based on CORMINE database, 161 miRNAs and 57 miRNAs had metastasis and stemness features respectively. We obtained 7 common miRNAs that 4 of them including hasmiR34a, hasmiR23a, hasmiR30a, hasmiR100 has a significant role for targeting signaling pathways involved in cancer and their most important targets regulate many processes of cells. These data suggest that three important properties can regulate by common miRNAs. Therefore, target these miRNAs or their targets can be helpful to stop tumor growth and metastasis and may be useful biomarkers for early detection of gastric cancer.
|
Keywords
|
Gastric cancer ,miRNA ,Metastasis ,Stem Cell ,Drug Resistance ,miRNA
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|