>
Fa   |   Ar   |   En
   شناسایی آپتامر Dnaای با تمایل بالا علیه آنتی‌ژن سطحی هپاتیت B با روش تکامل سیستماتیک لیگاند از طریق غنی‌سازی نمایی  
   
نویسنده انباری‌میبدی سمیرا ,ارجمند ساره ,راشدی حمید ,رعنایی‌سیادت امید ,پوریعقوبی محمد
منبع زيست فناوري - 1397 - دوره : 9 - شماره : 3 - صفحه:317 -323
چکیده    اهداف: هپاتیت b عفونت ویروسی است که می تواند منجر به مشکلات جدی کبدی شود. برای تولید واکسن هپاتیت b از آنتی ژن سطحی ویروس هپاتیت b (hbsag) که به صورت نوترکیب تولید می شود، استفاده می شود. هدف پژوهش حاضر شناسایی آپتامر dnaای با تمایل بالا علیه آنتی ژن سطحی هپاتیت b با روش تکامل سیستماتیک لیگاند با استفاده از غنی سازی نمایی بود.مواد و روش ها: در پژوهش تجربی حاضر با استفاده از روش تکامل سیستماتیک لیگاند از طریق غنی سازی نمایی (​selex( قطعه dnaای با قدرت اتصال بالا علیه hbsag، جداسازی و توالی یابی شد. تمایل این توالی نوکلئوتیدی تک رشته ای با روش فلوریمتری محاسبه شد. اختلاف جذب اولیه و مقدار باقی مانده به عنوان معیاری از میزان توالی های متصل شده با کمک نرم افزار prism 5 به روش رگرسیون غیرخطی، محاسبه bindingsaturation و مدل one sitetotal انجام و میزان میل ترکیبی (kd) تعیین شد.یافته ها: نتایج بعد از انجام رویه selex و ارزیابی توالی تکثیریافته با ژل آگارز، نمونه کنترل مثبت دارای باندی در محدوده 72نوکلئوتید بود که نشان دهنده تکثیر موفق توالی گزینش شده با استفاده از آغازگزهای انتخابی بود. میل ترکیبی محاسبه شده 81/53نانومولار بود. طی مراحل همسانه سازی از روی کلنی های موجود واکنش pcr با آغازگرهای اختصاصی آپتامر، حضور قطعه آپتامر در باکتری اشریشیا کلی تایید شد. آپتامر گزارش شده دارای ساختار ثانویه پایدار با داشتن انرژی آزاد g delta; کمتر از 9/6کیلوژول و tm بالاتر از c deg;45 بود.نتیجه گیری: آپتامر dnaای گزینش شده دارای قدرت اتصال بالا به پروتئین هدف (hbsag) است و می تواند به عنوان جایگزینی برای پادتن ها، در ستون های کروماتوگرافی تمایلی تخلیص hbsag مورد توجه قرار بگیرد.
کلیدواژه آنتی‌ژن سحطی هپاتیت B، غنی‌سازی نمایی، آپتامر Dnaای، لیگاند تمایلی
آدرس دانشگاه تهران, دانشکده مهندسی شیمی, گروه بیوتکنولوژی, ایران, دانشگاه شهید بهشتی, ایران, دانشگاه تهران, دانشکده مهندسی شیمی, گروه بیوتکنولوژی, ایران, دانشگاه شهید بهشتی, دانشکده فناوری‌های نوین, گروه بیوتکنولوژی, ایران, دانشگاه تربیت مدرس, دانشکده علوم زیستی, گروه نانوبیوتکنولوژی, ایران
 
   Detection of DNA Aptamer with High Affinity against Hepatitis B Surface Antigen by Systematic Evolution of Ligands by Exponential Enrichment  
   
Authors Rashedi H. ,Rashedi H. ,Pouryaqubi M. ,Arjmand S. ,Ranaei Siadat S.O.
  
 
 

Copyright 2023
Islamic World Science Citation Center
All Rights Reserved