آنالیز ترانسکریپتوم بافت برگ ارقام جو متفاوت در تشکیل زیست توده در مرحله زایشی

کشف همبستگی میان تجمع زیست‌توده در گیاه و عملکرد، پیش نیاز درک ارتباط بین داده های امیکس و میزان رشد در گیاهان است. برای جستجوی این ارتباط بین ترانسکریپت‌ها و نقش تنظیمی آنها در تشکیل زیست‌توده لیگنوسلولزی در فاز زایشی جو، پروفایل ترانسکریپت‌ها دو هفته پس از گلدهی در 3 لاین جو بهاره مورد استفاده قرار گرفت. یک ریزآرایه سفارشی (custom microarray) متشکل از 56000 اولیگونوکلئوتید برای آنالیز ترانسکریپتوم برگ پرچم در مرحله زایشی استفاده شد. شبکه ی همبستگی ترانسکریپت‌های درگیر در متابولیسم ثانویه و متابولیسم rna، دارای تعداد بیشتری همبستگی مثبت نسبت به منفی بود که از این بین یک سیگنال ملکول،abh1cap binding protein بالاترین میزان اتصال را به دیگر ترانسکریپت‌ها نشان داد. آنالیز آماری یک همبستگی مثبت بین abh1cap binding protein و یک ژن کلیدی مسیر فنیل پروپانویید، به نام cinnamoylcoa reductase نشان داد. تلفیق داده های بدست آمده پیشنهاد کننده ی این موضوع هستند که ژن (ccr) cinnamoylcoa reductase ممکن است بتوانند به‌عنوان بیومارکر برای مهندسی اصلاح زیست‌توده لیگنوسلولزی در فاز زایشی جو استفاده شود.