|
|
ارزیابی میزان تغییرات بیان ژن های خانه دار در برهمکنش گندم با بیمارگر mycosphaerella graminicola با روش reverse northern dot blot
|
|
|
|
|
نویسنده
|
غلامنژاد جلال ,سنجریان فروغ ,محمدی گلتپه ابراهیم ,صفایی ناصر ,رضوی خدیجه
|
منبع
|
زيست فناوري گياهان زراعي - 1394 - دوره : 5 - شماره : 12 - صفحه:1 -10
|
چکیده
|
بهطور کلی ژنهای مرجع در تجزیه و تحلیلهای بیان ژن، از بین ژنهای خانهدار انتخاب میشوند، اما تغییرات دیده شده در مقدار بیان مانع اساسی برای استفاده بهینه از آنهاست. از آنجا که بیان هیچ تک ژنی در شرایط مختلف و سلولهای متفاوت ثابت نیست، معرفی و اعتبارسنجی ژنهای مرجع بسیار مهم است. در این تحقیق مناسب بودن هفت ژن خانهدار گندم برای نرمالسازی بیان mrna در برگ این گیاه در هنگام آلودگی به قارچ mycosphaerella graminicola مطالعه شده است. به این منظور بیان ژنهای رمزکنندۀ اکتین، روبیسکو، گلیسرآلدهید 3 فسفات دهیدروژناز ، فاکتور طویلسازی ترجمۀ 1 آلفا (tef 1α)، آلفاتوبولین، فاکتورهای آزادکنندۀ یوکاریوتی 1 و 3 (erf1 و erf3) در طول آلودگی توسط روش نوردن بلات معکوس اندازه گیری، و توسط نرم افزارهای اکسل و sas از لحاظ آماری بررسی شد. بیان ژنهای آلفاتوبولین، tef 1α و اکتین از بیشترین پایداری برخوردار بود و ژنهای روبیسکو و گلیسرآلدهید 3 فسفات دهیدروژناز کمترین ثبات بیان را داشتند. مطالعه مقایسهای تغییرات در بیان ژنهای مختلف خانهدار گندم در پاتوسیستم گندم m. graminicola انتخاب ژنهای مرجع را برای روش لکهگذاری نوردنبلات معکوس تسهیل میکند.
|
کلیدواژه
|
آنالیزهای بیان ژن، ژنهای مرجع، پاتوسیستم گندم m. graminicola، لکه گذاری نوردن بلات معکوس
|
آدرس
|
دانشگاه اردکان, دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی, ایران, پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری, پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی, ایران, دانشگاه تربیت مدرس, دانشکدۀ کشاورزی, بخش بیماری شناسی گیاهی, ایران, دانشگاه تربیت مدرس, دانشکدۀ کشاورزی, بخش بیماری شناسی گیاهی, ایران, پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری, پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی, ایران
|
پست الکترونیکی
|
razavi@nigeb.ac.ir
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Evolution of housekeeping Genes for Gene Expression in Wheat Leaves Infected by Mycosphaerella graminicola with Reverse northern dot blot
|
|
|
Authors
|
Gholamnezhad Jalal ,Sanjarian Forogh ,Mohammadi Goltapeh Ebrahim ,Safaei Naser ,Razavi Khadijeh
|
Abstract
|
As a rule the reference genes used in gene expression analysis have been selected for their housekeeping roles, but the variation observed in most of them is a major obstacle to their effective use. It is widely supported to identify and validate stable reference genes, since no single biological gene is stably expressed between cell types or within cells under different conditions. In this study, suitability of seven wheat housekeeping genes for normalization of mRNA expression in wheat leaves infected by Mycosphaerella graminicola was investigated. Expression level of Actin, Rubisco, Glyceraldehyde3phosphate dehydrogenase (GAPDH), Translation Elongation Factor 1α (TEF1α), αTubollin, eukaryotic release factors 1 and 3 (ERF1 and ERF3) genes were examined by reverse northern dot blot method. Expression stabilities of the reference genes were statistically analyzed by Ecxel and SAS softwares. αTubolin, TEF1α and Actin were the three most stable genes whereas the expression of Rubisco and GAPDH had the least stability. The presented comprehensive data on changes in expression of various wheat housekeeping genes in wheat M. graminicola phatosystem facilitate selection of reference genes for Reverse northern dot blot method.
|
Keywords
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|