شناسایی qtl‌های مرتبط با جوانه زنی گندم در شرایط معمولی و تنش خشکی

جوانه زنی بذر (ظرفیت، زمان، میزان و همزمانی) از خصوصیات بارز و مهم یک رقم زراعی توصیف می شوند. به منظور شناسایی نواحی ژنومی کنترل کننده صفات مرتبط با جوانه زنی دانه گندم، 149 لاین هاپلوئید و والدین آنها rojo yecora و no. 49 طی سال زراعی 93-1392 در قالب طرح آلفا لاتیس در دو شرایط عادی و تنش رطوبتی اجرا گردیدند. صفات ضریب سرعت جوانه‌زنی، درصد جوانه زنی نهایی، سرعت جوانه‎زنی، شاخص میزان جوانه زنی و متوسط جوانه زنی روزانه مورد اندازه‎گیری قرار گرفتند. در این بررسی، 340 جفت آغازگر ریزماهواره برای تعیین چند‌شکلی والدین استفاده گردید. همچنین از هفت آغازگر رتروترانسپوزونی مبتنی بر نواحی ltr رتروترانسپوزون های جو و 28 ترکیب آن ها در تکنیک irap و از ترکیب این آغازگر با آغازگرهای issr (63 ترکیب) در تکنیک remap برای غربال جمعیت استفاده شد. تجزیه qtl به روش نقشه یابی فاصله ای مرکب (cim) برای هر صفت در هر محیط و میانگین دو محیط انجام گردید. برای همه صفات مورد مطالعه، تفکیک متجاوز مشاهده شد. در مجموع، 11 qtl برای صفات مورد مطالعه شناسایی گردید. واریانس فنوتیپی کل تبیین شده بوسیله این qtl ها از82/11 تا 42/21 درصد متغیر بود (بیشترین مقدار lod برایqtl کنترل کننده سرعت جوانه 65/6= lod روی کروموزوم 4b (sgnormal 4b) به‌دست آمد. نتایج نشان داد که qtl های شاخص میزان جوانه‌زنی و سرعت جوانه‌زنی مربوط به کمیت و کیفیت جوانه‌زنی در هر دو شرایط از تظاهر خوبی برخوردار بودند. لذا از qtl های پایدار و خوشه ای شناسایی شده می توان در برنامه گزینش به کمک نشانگر (mas)، استفاده نمود.

Mapping QTLs associated with wheat seed germination under normal and drought stress conditions

Seed germination (capacity, time, and synchronization) is a manifest characteristic of the standard germination test of a cultivated variety. In order to identify genomic regions associated with seed germination, 149 bread wheat recombinant inbred lines and their parents RojoYecora and No. 49 were conducted  in an alpha lattice design with two replications at the University of Mahabad during 201314, under normal and moisture stress conditions. Different traits including index of germination speed, final germination percentage, germination speed, germination rate, and average daily germination were measured. In this study, 340 pairs of microsatellite primers were used to determine the parental polymorphism. Furthermore, 7 retrotransposonbased markers on LTR regions of barely retrotransposons, and their twentyeight combinations at IRAP technique, as well as, 63 combination of this primer with anchored ISSR primers at REMAP technique were used for population screening. QTL analysis using composite interval mapping (CIM) for each trait in each environment and mean of two environments were accomplished. For all studied traits, transgressive segregation was observed. In general, eleven QTLs were detected for all traits. Total phenotypic variance explained by these QTLs varied from 11.82 to 21.42 percent. The highest LOD value for QTL controlling germination speed (LOD =6.65)  was obtained on  chromosome 4BQSgNormal. The results revealed that QTLs of index of germination rate and germination speed related to the quantity and quality of seed germination had desirable performance in all three environments. However, detected stable and cluster QTLs may be used in marker assisted selection (MAS) programs.