مقایسه مولکولی ناحیه ''5 ژنوم جدایه گلستان ویروس موزاییک کوتولگی ذرت (Mdmv) با دیگر پوتی ویروس های غلات

ویروس موزاییک کوتولگی ذرت (maize dwarf mosaic virus, mdmv)یکی از مهم ترین و گسترده ترین ویروس های ذرت در دنیا می باشد. تحقیق حاضر به‌منظور مقایسه خصوصیات مولکولی و آنالیز ترادف نوکلیوتیدی نواحی کد کننده پروتیین های موجود در ناحیه ?5 ژنوم ویروس موزاییک کوتولگی ذرت و مقایسه آن با سایر جدایه های این ویروس و نیز سایر پوتی ویروس های غلات انجام گردید. بدین‌منظور گیاهان ذرت با علایم موزاییک و کوتولگی از استان گلستان جمع‌آوری شد. پس از تعیین آلودگی در آزمون الایزای غیرمستقیم با آنتی‌سرم اختصاصی mdmv یک نمونه آلوده جهت استخراج rnaی کل انتخاب شد. جهت تکثیر ناحیه ی ?5 ژنوم ویروس از 5 جفت آغازگر اختصاصی استفاده شد که 5 قطعه همپوشان شامل utr-?5، p1، hc-pro، p3و 6k1 به اندازه کل 3460 جفت باز به‌دست آمد. آنالیز های مقایسه ای ترادف نوکلیوتیدی این ناحیه از ژنوم mdmv نشان داد که جدایه ایران (گلستان) به‌ترتیب دارای شباهت 7/95 و 3/92 درصد در سطح آمینواسیدی و 5/90 و 1/85 درصد در سطح نوکلیوتیدی با جدایه های بلغارستان و اسپانیا است و در مقایسه با سایر ویروس های آلوده‌کننده غلات هم گروه با mdmv بیشترین شباهت با ویروس موزاییک سورگوم از تگزاس و ویروس موزاییک نیشکر از چین به‌ترتیب با 9/72 و 3/72 درصد به‌دست آمد.