|
|
بررسی تنوع ژنتیکی پروانه جوانه خوار بلوط tortrix viridana (lep. tortricidae) درجنگل های بلوط زاگرس با استفاده از s rdna28
|
|
|
|
|
نویسنده
|
موسیوند رضوان ,مجدی محمد ,فاتحی فواد ,غباری حامد
|
منبع
|
زيست فناوري گياهان زراعي - 1402 - دوره : 13 - شماره : 2 - صفحه:31 -33
|
چکیده
|
یکی از مضرترین آفات جنگل های زاگرس پروانه ی جوانه خوار بلوط (tortrix viridama (le tortricidae ..است. تنوع ژنتیکی جمعیتهای گیاه میزبان پروانه جوانه خوار بلوط در جنگلهای بلوط شمال غرب ایران و منطقه ی زاگرس شمالی با استفاده از توالی ژن 28 بررسی شد جمع آوری نمونه ها در مناطق جنگلی استانهای آذربایجان غربی ،لرستان کردستان و کرمانشاه صورت گرفت نمونه های جمع آوری شده که در مرحله ی لاروی بودند تا زمانی که به شفیره و سپس به حشره ی کامل تبدیل ،شوند در آزمایشگاه نگهداری شدند. استخراج dna به روش ctab انجام و به منظور تکثیر ناحیه 285 از توالی ژن 28s جنس tortrix از ncbi برای طراحی پرایمر استفاده شد ناحیهی مورد نظر با استفاده از روش pcr تکثیر و محصولات pcr توالی یابی شدند. 21 نمونه برای بررسی تنوع ژنتیکی با استفاده از ژن 28 انتخاب شد که 18 نمونه با کیفیت بالاتر توالی dna برای بررسی های بیشتر مورد استفاده قرار گرفت توالیهای dna با استفاده از نرم افزار bioedit ویرایش و با نرم افزار megax تراز شد و درخت فیلوژنتیک به روش upgma با 1000 تکرار نمونه برداری ترسیم گردید. ارزیابی ساختار ژنتیکی جمعیتها نشان داد که تنوع مابین جمعیتها بیشتر از درون جمعیتها است. نتایج درخت فیلوژنتیک نیز نشان داد که نمونههای مختلف پروانه جوانه خوار بلوط بر اساس فاصله ی جغرافیایی دارای تنوع ژنتیکی هستند. بنابراین زمان ظهور ،آفت رفتار و نوع کنترل و مدیریت آفت آنها هم متفاوت است.
|
کلیدواژه
|
28s rdna ، آفت، فاصله جغرافیایی ، tortrix viridana
|
آدرس
|
دانشگاه کردستان, گروه ژنتیک و تولید گیاهی, ایران, دانشگاه کردستان, گروه ژنتیک و تولید گیاهی, ایران, دانشگاه پیام نور مرکز تهران, گروه کشاورزی, ایران, دانشگاه کردستان, گروه گیاهپزشکی, ایران
|
پست الکترونیکی
|
ghobari@gmail.com
|
|
|
|
|
|
|
|
|
genetic diversity of the green oak leaf roller moth, tortrix viridana (lep., tortricidae) in zagros oak forests using s rdna28
|
|
|
Authors
|
mousivand rezvan ,majdi mohammad ,fatehi foad ,ghobari hamed
|
Abstract
|
the genetic diversity of the t. viridana on the host oak species quercus branti was investigated using the 28s gene sequence in some zagros forests. the samples were collected from the forest area of west azarbaijan, lorestan, kurdistan and kermanshah provinces. the collected samples, which were in the larval stage, were grown in laboratory conditions until they turned into paup and then into complete insects, for dna extraction. dna extraction was done by ctab method. 21 samples were selected to investigate genetic diversity using the 28s gene, and 18 sequences dnas were of suitable quality for further investigations. in order to amplify 28s region, based on the sequence obtained from the ncbi site.the desired region in the collected samples was amplified using the pcr method and the resulting product was sequenced. the sequences were edited using bioedit software and aligned with the help of megax software, and the phylogenetic tree was drawn by upgma method with 1000 sampling repetitions. the results of this study, based on the phylogenetic tree, showed that the different samples of the oak saplings have genetic diversity based on the geographical distance. assessment of genetic structure of the populations showed that higher diversity was demonstrated in intrapopulations than interpopulations geographically. 28s gene showed the presence of 5 haplotypes in these populations. the presence of low diversity between populations indicated the existence of gene flow between populations as well as genetic compatibility in the studied populations.
|
Keywords
|
tortrix viridana ,pest ,geographical distance ,28s rdna
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|