|
|
|
|
مطالعه پاسخ پروتئینی ریشه آفتابگردان به تنش خشکی با رهیافت پروتئومیکس
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
غفاری مهدی ,شریفی سعادت ,بخشی خانیکی غلامرضا
|
|
منبع
|
زيست فناوري گياهان زراعي - 1397 - دوره : 8 - شماره : 22 - صفحه:15 -26
|
|
چکیده
|
برای درک مکانیسم مولکولی تحمل به خشکی در ارتباط با ریشه آفتابگردان، الگوی پروتئوم ریشه دو لاین حساس و متحمل به خشکی در شرایط آبیاری محدود و مطلوب بررسی شد. با استفاده از الکتروفورز دو بعدی و مقایسه شدت نسبی لکه‌ها با آزمونt تعداد 12 لکه از 417 لکه پروتئینی در لاین حساس و 17 لکه از 467 لکه پروتئینی در لاین متحمل به طور معنی‌داری از تنش خشکی متاثر شد. لکه‌های پروتئینی با استفاده از طیف‌سنجی جرمی nano-lc ms/ms توسط جستجوگر مسکات با در نظر گرفتن حداقل 10% همپوشانی و امتیاز بالاتر از 80 در پایگاه ncbi شناسایی شدند. پروتئین‌های سیتوپلاسمی و هسته‌ای به ترتیب بیش از سایر پروتئین‌ها از محدودیت آب متاثر شدند. سه لکه پروتئینی انولاز، گلیسرآلدئید تری فسفات دهیدروژناز و چالکون سینتاز با بیان متمایز در هر دو لاین حساس و متحمل شناسایی شد. کاهش شدت نسبی انولاز در لاین متحمل دلالت بر آسیب متابولیکی بود که می‌تواند منجر به کاهش فرایندهای پایین دست در اثر محدودیت ناشی از خشکی باشد. در مقابل افزایش شدت نسبی گلیسرآلدئید تری‌فسفات دهیدروژناز و چالکون‌سینتاز در لاین متحمل نشان‌دهنده توانایی این لاین در سمیت‌زدایی/ترمیم آسیبهای ناشی از تخریب اکسیداتیو و دفاع ضداکسیداتیو در شرایط تنش بود. افزایش شدت نسبی پروتئین شوک‌دمایی، دی‌هیدروفلاونول ردوکتاز، لیپواکسیژناز لینولئات‌دانه، یوبیکوئیتین کربوکسیل‌ترمینال هیدرولاز و جی پروتئین در لاین متحمل نشان‌دهنده اهمیت فرایندهای دفاعی، حفاظتی و ترارسانی برای کاهش آسیبهای ناشی از خشکی است.
|
|
کلیدواژه
|
الکتروفورز دوبعدی، انولاز، پروتئین شوک دمایی، طیف سنجی جرمی
|
|
آدرس
|
سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی, موسسه تحقیقات، اصلاح و تهیه نهال و بذر, ایران, دانشگاه پیام نور, ایران, دانشگاه پیام نور, گروه زیست‌شناسی, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
The study of protein response of sunflower root to drought stress using proteomics approach
|
|
|
|
|
Authors
|
Ghaffari Mehdi ,Sharifi Saadat ,Bakhshi Khaniki Gholamreza
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|