|
|
|
|
تعیین دامین های کارکردی و مدل توپولوژی ژن دلتا 6 دسچوراز غشائی قارچ mortierella alpina
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
اشعار قدیم عصمت ,قرنجیک شاهرخ ,باغبان کهنه روز بهرام
|
|
منبع
|
زيست فناوري گياهان زراعي - 1395 - دوره : 6 - شماره : 15 - صفحه:13 -23
|
|
چکیده
|
دسچورازها (ec: 1.14.19.3) کاتالیزگرهای واکنش دهیدروژناسیون بوده و باعث ایجاد پیوند دوگانه در زنجیره اسیدچرب می‌شوند. این آنزیم‌ها به دو گروه محلول و غشائی تقسیم گردیده، هر یک دارای موتیف‌های متفاوتی می‌باشند. با اینکه دلتا 6 دسچوراز آنزیم کلیدی در بیوسنتز اسیدهای‌چرب غیراشباع می‌باشد، ولی بخاطر غشایی بودن، ساختار کریستالی و سه‌بعدی آن تعیین نگردیده است. قارچ mortierella alpina منبع غنی تولید اسیدچرب غیراشباع اسید آراشیدونیک بوده و دارای آنزیم دلتا 6 دسچوراز فعالی می‌باشد. هدف از این تحقیق، دستیابی به توالی کدکننده ژن دلتا 6 دسچوراز و تعیین جایگاه دامین‌های کارکردی با استفاده از آنالیزهای مقایسه‌ای و مدل‌های مولکولی و پیشنهاد یک مدل توپولوژی غشائی برای این آنزیم می‌باشد. بدین منظور پس از استخراج rna و سنتز cdna توسط آغازگرهای اختصاصی، همسانه‌سازی در ناقلpbluescriptsk+ انجام و سپس توالی‌یابی شد. بر اساس بررسی‌های بیوانفورماتیکی توسط سرورهای swissmodel، predict و phobius وجود دامین سیتوکروم b5 حاوی موتیف (hpgg)، 3 موتیف جعبه هیستیدینی و نواحی ترانس‌ممبران تعیین و سپس یک مدل توپولوژی غشائی برای توالی موردنظر پیشنهاد گردید.
|
|
کلیدواژه
|
آنزیم دلتا 6 دسچوراز، دسچوراز غشائی، دامین، قارچ mortierella alpina
|
|
آدرس
|
دانشگاه صنعتی شاهرود, دانشکده کشاورزی, ایران, دانشگاه صنعتی شاهرود, دانشکده کشاورزی, ایران, دانشگاه تبریز, دانشکده کشاورزی دانشگاه تبریز, گروه به نژادی و بیوتکنولوژی گیاهی, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Determination of functional domains and topology model of membranebound Delta6 desaturase enzyme from Mortierella alpina
|
|
|
|
|
Authors
|
Ashaar Ghadim Esmat ,Gharanjik Shahrokh ,Baghban Kohnerouz Bahram
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|