|
|
|
|
جداسازی، همسانه‌سازی و تحلیل بیوانفورماتیکی ژن کد کننده هیستامیناز نخود (cicer arietinum) توده بومی گریت
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
کریم بیگی هادی ,نظریان فیروزآبادی فرهاد ,گلکاری صابر ,اسماعیلی احمد ,علیرضایی مسعود
|
|
منبع
|
زيست فناوري گياهان زراعي - 1397 - دوره : 8 - شماره : 24 - صفحه:15 -27
|
|
چکیده
|
هیستامین، یک آمین بیوژنیک مهم، توسط بسیاری از ارگانیسم‌ها تولید می‌شود و نقش‌‌های متنوعی در حیات و زندگی جانداران دارد. ذخیره هیستامین در غذا به خصوص در محصولات غذایی کنسرو شده مانند تن ماهی، سلامتی انسان‌ها را تهدید و به بدن فرد آسیب می‌رساند. دی آمین اکسیداز یا هیستامیناز، هیستامین موجود در بدن انسان را تجزیه و از اثرات مضر آن می‌کاهد. در این مطالعه cdna کدکننده کامل یک آنزیم آمینواکسیداز، از نخود توده بومی گریت جداسازی شد و در پایگاه genbank به شماره دسترسی ku058599 ثبت گردید. به‌علاوه این توالی در یک پلاسمید بیانی همسانه سازی شد. cdna جداسازی شده دارای یک orf با طول bp2013، پروتئینی با 670 اسید آمینه و وزن مولکولی kda 75.7 را تولید می‌کند. نتایج آنالیزهای هم ردیفی توالی چندگانه این پروتئین نشان داد که جایگاه‌های فعال و اسید آمینه‌های مهم در هیستامیناز باکتری ای‌کولای، نخود زراعی و نخود بومی گریت بسیار حفاظت شده هستند. بررسی‌های بیوانفورماتیکی نشان داد که هیستامیناز توده بومی گریت با هیستامیناز نخود موجود در پایگاه genbank (caa08855) در 4 اسید آمینه با هم اختلاف داشتند. نتایج حاصل از آنالیز فیلوژنتیکی هیستامینازهای موجودات مختلف نشان داد که هیستامیناز نخود توده بومی گریت با هیستامینازهای گیاهان و مخصوصا خانواده لگومینوزها با بوت استرپ 99% در یک گروه قرار گرفتند.
|
|
کلیدواژه
|
هیستامیناز، جایگاه فعال، فیلوژنی، همسانه سازی، نخود
|
|
آدرس
|
دانشگاه لرستان, دانشکده کشاورزی, گروه زراعت و اصلاح نباتات, ایران, دانشگاه لرستان, دانشکده کشاورزی, گروه زراعت و اصلاح نباتات, ایران, سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی, موسسه تحقیقات کشاورزی دیم کشور, ایران, دانشگاه لرستان, دانشکده کشاورزی, گروه زراعت و اصلاح نباتات, ایران, دانشگاه لرستان, دانشکده دامپزشکی, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Isolation, cloning and bioinformatic analysis of a histaminase encoding gene from chickpea grit landrace (Cicer arietinum L.)
|
|
|
|
|
Authors
|
Karimbeigi Hadi ,Nazarian Firouzabadi Farhad ,Golkari Saber ,Ismaili Ahmad ,Alirezaei Masoud
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|