کاربرد روش DGGE در بررسی تنوع ژنتیکی ژن Na+/K+ ATPase در جمعیت-های آرتمیا

روش dgge در انگشت‌نگاری مولکولی قادر است تفاوت‌ قطعات dna دو رشته‌ای را بر اساس نقطه ذوب آن‌ها در داخل یک ژل دناتوره کننده آشکار سازد. در این تحقیق به منظور بررسی تنوع ژنتیکی در بخشی از ژن na+/k+ atpase، اگزون شماره 7 این ژن در جمعیت‌های artemia با نام‌های artemia urmiana، parthenogenetic artemia, urmia lake lagoons،parthenogenetic artemia, incheh lake وparthenogenetic artemia, maharlu lake از ایران در مقایسه با دو جمعیت آرتمیای غیر بومی a. franciscana و a. sinica با استفاده از روش‌های dgge، rflp و تعیین توالی مورد بررسی قرار گرفت. بدین منظور پس از استخراج dna، اگزون شماره 7 این ژن با استفاده از آغازگرهای اختصاصی جنس آرتمیا تکثیر یافت. برش آنزیمی قطعه 280 جفت بازی به-وسیله 8 آنزیم برش اندونوکلئاز نتوانست هیچ تفاوت مولکولی در این اگزون را نمایش دهد. استفاده از روش dgge برای تفکیک محصول pcr بر روی ژل دناتوره کننده نشان داد که این اگزون به شدت در بین گونه‌های آرتمیا چندشکلی دارد که قبلا توسط روش rflp شناسایی نشده بود. تایید نتایج dgge توسط تعیین توالی و محاسبه فاصله ژنتیکی تنوع نوکلئوتیدی در این اگزون در جمعیت‌های آرتمیا نشان داد که احتمالا این اگزون دارای نقش بسیار مهمی در ساختار پمپ سدیم- پتاسیم بوده که در طی روند تکاملی آرتمیا و تولید سویه‌های دو جنسی و پارتنوژنز نقش دارد.