مطالعه تنوع ژنتیکی جدایه‌‍‌‌های Xanthomonas oryzae pv. oryzae از مزارع برنج استان گیلان با استفاده از نشانگر مولکولی RAPD

بلایت باکتریایی برگ برنج، ناشی از باکتری xanthomonas oryzae pv. oryzae (xoo) بوده و یک بیماری مهم در سرتاسر آسیا است. کاهش محصول ناشی از این بیماری، از 10 تا 70 درصد در مزارع شدیداً آلوده گزارش شده است. در این بررسی، تنوع ژنتیکی 60 جدایه xoo، با استفاده از نشانگر rapd مورد ارزیابی قرار گرفت. در مجموع، نشانگرهای مورد استفاده، 187 نوار چند شکل ایجاد کردند. تجزیه واریانس مولکولی داده‌های rapd نشان داد که تنوع ژنتیکی درون جمعیتی نسبت به بین جمعیت‌ها بیشتر بوده است. ماتریس تشابه با استفاده از ضریب تشابه تطابق ساده، ایجاد شده و تجزیه خوشه‌ای به روش upgma و توسط نرم‌افزار ntsys-pc انجام گردید. در سطح تشابه 6/0 جدایه‌ها به سه گروه تقسیم شدند. نتایج حاصل از این بررسی نشان داد که نشانگرهای rapd به کار گرفته شده در این بررسی، قادر به تمایز جدایه‌های خزانه و مزرعه از یکدیگر بودند.