تجزیه و تحلیلی جامع بر خانواده ژنی snakin/gasa: بینشی بر منشاء، گسترش، تنوع و بیان آن‌ها

خانواده nakin/gasa پپتیدهای کوچک غنی از سیستئینی هستند که به‌طور گسترده در ژنوم گیاه توزیع شده و در رشد و توسعه و پاسخ گیاهان به تنش‌های زیستی  و غیرزیستی نقش دارند. در مطالعه حاضر، وجود خانواده ژنی gasa در موجودات مختلف بررسی شد همچنین ساختار و تغییرات بیان این خانواده ژنی در  گیاهان  مختلف مقایسه شد. علاوه بر این، تغییرات پس از ترجمه و خاصیت ضد میکروبی پروتئین‌های gasa برای درک بیشتر مکانیسم‌های تنظیمی پیش‌بینی شد. حضور  دمین gasa، پپتید سیگنال، تجمع خارج سلولی، شش پل دی‌سولفیدی، فسفوریلاسیون پس از ترجمه و فعالیت ضدمیکروبی برای همه ژن‌های gasa مشاهده شد. الگوی بیان متفاوت در بافت‌های مختلف (logfpkm= 0- 2.5) و القا تحت تنش‌های زیستی، غیرزیستی و هورمونی (در بازه logfold change= -10 - +5 در شرایط خشکی و گرما) از دیگر ویژگی‌های این ژن‌ها بود و همچنین عناصر سیس تنظیم کننده کلیدی در نواحی پیشبر این ژن ها شناسایی شد که بیانگر این است که ژن های snakin/gasa به عنوان یک خانواده ژنی مهم، نقش و عملکرد های متنوعی دارند. همچنین نتایج نشان داد که اغلب پروتئین‌های gasa مورد مطالعه بر اساس خصوصیات فیزیکوشیمیایی، ناپایدار و آبگریز بودند. همچنین، برهمکنش قوی بین ژن‌های خانواده gasa و عوامل رونویسی از خانواده‌های dof، erf و myb در آرابیدوپسیس و برنج پیش‌بینی شد. به طور کلی، این نتایج می تواند دانش ما را در مورد عملکرد ژن‌های gasa بهبود بخشد و داده‌هایی را برای تحقیقات آینده فراهم کند.

a comprehensive analysis of the snakin/gasa gene family: insights into their origin, expansion, diversity and expression

the snakin/gasa family consists of small, cysteine-rich peptides that are widely distributed across plant genomes, playing crucial roles in plant growth, development, and responses to biotic and abiotic stresses. in this study, the presence of the gasa gene family across various organisms was examined, and structural and expression variations of these genes were compared in different plant species. additionally, post-translational modifications and the antimicrobial properties of gasa proteins were predicted to provide further insight into their regulatory mechanisms. key characteristics observed for all gasa genes included the presence of the gasa domain, signal peptides, extracellular accumulation, six disulfide bridges, post-translational phosphorylation, and antimicrobial activity. differential expression patterns were noted in various tissues (logfpkm = 0-2.5), with induction under biotic, abiotic, and hormonal stresses (logfold change ranging from -10 to +5, particularly under drought and heat conditions). furthermore, key cis-regulatory elements were identified in the promoter regions of these genes, highlighting the diverse roles and functions of the snakin/gasa gene family. physicochemical analysis revealed that most of the studied gasa proteins were unstable and hydrophobic. a strong interaction was also predicted between the gasa gene family and transcription factors from the dof, erf, and myb families in both arabidopsis and rice. overall, these findings provide valuable insights into the functional diversity of gasa genes and offer a foundation for future research.