بررسی بیان mir160 و mir393 و ژن های هدف آنها در نیشکر تحت تنش غرقابی

غرقابی یکی از تنش‌ های غیرزیستی است که رشد و عملکرد نیشکر را کاهش می دهد. نیشکر نسبتاً به تنش غرقابی متحمل است با این حال میزان آسیب به گیاه به ژنوتیپ، شرایط محیطی، مرحله ی رشد و مدت زمان تنش بستگی دارد. به‌ دلیل عدم وجود اطلاعات کافی از نقش تنظیمی mirnaها و ژن های هدف آن‌ها در پاسخ گیاه نیشکر به تنش غرقابی، براساس نتایج حاصل از مطالعات در گیاهان مدل و هم خانواده از جمله سورگوم، mir160 و mir393 و ژن‌های هدف آن‌ها یعنی aef17 و afb2 انتخاب و بیان آن‌ها با استفاده از روش qrt-pcr در دو واریته تجاری cp48-103 و cp69-1062 تحت تیمار 7 و 14 روز تنش غرقابی در مقایسه با گیاهان شاهد مورد بررسی قرار گرفت. نتایج مقایسه بیان نسبی نشان داد، mir160 و mir393 در هر دو واریته تحت شرایط تنش افزایش بیان داشتند و نقش مهار منفی آن‌ها در کاهش بیان ژن هدف یعنی arf17 و afb2 نمایان گشت. نقش تنظیم منفی mir160 و mir393 بر ژن‌های arf17 و afb2 در تنش 14 روز بیش‌تر بود، همچنین در واریته cp69-1062 در مقایسه با واریته cp48-103 این نقش برجسته‌تر بود.

investigating the expression of mir160 and mir393 and their regulatory role in stimulating the growth of sugarcane aerial roots

waterlogging is one of the abiotic stresses that reduce the growth and productivity of sugarcane. sugarcane is relatively tolerant to waterlogging however the damage to this plant related to genotypes, environmental conditions, stage of development and the duration of stress. due to the lack of sufficient information on the regulatory role of mirnas and their target genes in the response of sugarcane to waterlogging stress, based on the results of studies in model and related plants such as sorghum, mir160 and mir393 and their target genes i.e. aef17 and afb2, their selection and expression were investigated using qrt-pcr method in two varieties cp48-103 and cp69-1062 under treatment of 7 and 14 days of waterlogging stress compared to control plants. the results of comparing the relative expression showed that mir160 and mir393 had an increased expression in both varieties under stress conditions, and their negative inhibition role in reducing the expression of the target genes, i.e. arf17 and afb2, was revealed. the role of negative regulation of mir160 and mir393 on arf17 and afb2 genes were more in 14 days stress, also this role was more prominent in cp69-1062 variety compared to cp48-103 variety.