بررسی ساختار ژنتیکی و اصالت اسب کُرد با استفاده از دوازده نشانگر میکروستلایت

با پیشرفت تکنیک های ژنتیک مولکولی، امروزه تعیین نسب در موجودات و بررسی روند تکاملی آنها امکان پذیر است. در این تحقیق تنوع ژنتیکی و انتساب اسب‌های نژاد کرد به جمعیت مبدا یا جمعیت‌هایی از اسب عرب و ترکمن با استفاده از 12 نشانگر ریزماهواره توصیه شده توسط انجمن جهانی ژنتیک حیوانی (isag) مورد ارزیابی قرار گرفت. برای این منظور از 238 راس اسب کرد، 36 راس اسب عرب و 30 راس اسب ترکمن در مناطق پراکنش آن‌ها خون گیری انجام شد. از نمونه‌های خون گرفته شده dna به روش نمکی بهینه یافته استخراج شد. dna به‌وسیله واکنش pcr چندگانه با استفاده از آغازگرهای نشان‌دار تکثیر و آلل‌های هر نشانگر توسط الکتروفورز موئین تعیین شد. میانگین تعداد آلل مشاهده شده و موثر برای تمام نشانگرها به‌ترتیب برابر با 9.50 و 4.71 محاسبه شد. بیشترین و کمترین هتروزیگوسیتی مورد انتظار به‌ترتیب در نشانگرهای asb17 (0.83) و htg4 (0.71) به‌دست آمد. تجزیه خوشه ای به روش upgma و ضریب dice، افراد هر نژاد را به‌صورت کاملا مجزا از هم تفکیک کرد. نتیجه آزمون انتساب بهوش بیزی نشان داد که نشانگرهای استفاده شده تمام افراد را به درستی به جمعیت مبداء منتسب نمود، بنابراین به‌نظر می‌رسد می توان از این نشانگرها با دقت بسیار زیاد در تفکیک افراد این نژادها از هم استفاده کرد. در مجموع نتایج حاصل از این تحقیق نشان داد که نشانگرهای ریزماهواره استفاده شده تنوع ژنتیکی بالایی بین کلیه افراد مورد مطالعه دارند، از این رو استفاده از این نشانگرها برای آزمون‌های انساب و انتساب اسب‌های کرد توصیه می‌شود، به‌طوری که می‌توان از این نشانگرها در راستای شتاخت و تعیین اصالت در اسب های نژادی کردی بهره جست و اسب های ناخالص را از روند تولید مثلی حذف نمود.

genetic structure and assignment tests of kurdish horse based on microsatellite markers

as the progress of molecular genetics techniques, it is now possible to determine the relationship between individuals and their evolutionary process. in this study, the genetic structure and assignment test of kurdish horses breed to its origin or arab and turkmen horses breed were investigated using 12 microsatellite markers recommended by the international society for animal genetics (isag). for this purpose, blood samples from 238 kurd, 36 arab and 30 turkmen horses were taken in their distribution areas. dna was extracted from blood samples by the salting-out method. dna fragments were amplified by multiplex pcr reaction using fluorescently labeled primers and determined by capillary electrophoresis. the mean of observed and effective alleles for all markers was 9.9 and 4.71, respectively. the highest and lowest expected heterozygosity was obtained for asb17 (0.83) and htg4 (0.71) markers, respectively. cluster analysis using the upgma method and the dice coefficient differentiated each breed. the result of the bayesian assignment test showed that all individuals correctly assigned to its population, so it seems that these markers are useful for the assignment test. overall, the results of this study showed that the microsatellite markers used in this study showed high genetic diversity, so the use of these markers for genetic diversity study and assignment test of the kurdish horse is recommended. so, these markers can be used to determine the exact origin of the kurdish horse breed and eliminated the non-purebred horses from the reproductive process.