|
|
شناسایی چندشکلی در جایگاه ژنی igf-i و ارتباط آن با فاکتور وضعیت در تاسماهی ایرانی (acipenser persicus)
|
|
|
|
|
نویسنده
|
زین الدینی میمند زهرا ,فرهادی ایوب ,رحیمی میانجی قدرت ,یگانه سکینه
|
منبع
|
ژنتيك نوين - 1398 - دوره : 14 - شماره : 4 - صفحه:319 -326
|
چکیده
|
هدف از این پژوهش بررسی چند شکلیهای موجود در ژن igf-i تاسماهی ایرانی (acipencer persicus) با استفاده از تکنیک pcr-sscp و همچنین بررسی ارتباط این چند شکلیها با صفات مرتبط به رشد ماهی (فاکتور وضعیت، طول و وزن بدن) بود. در این تحقیق تعداد 95 عدد تاسماهی ایرانی بهطور تصادفی از یکی از مزارع پرورشی استان گیلان انتخاب شده و نمونههای مورد نیاز برای استخراج dna از باله دمی جداسازی شدند. dna به روش نمکی بهینهسازی شده استخراج و دو قطعه 171 و 362 جفتبازی بهترتیب از نواحی5ʹ-utr و 3ʹ-utr ژن مورد نظر تکثیر شدند. تعیین ژنوتیپ افراد در نمونههای تاسماهی ایرانی، سه الگوی باندی مختلف m, k و g برای جایگاههای 171 و 362 جفتبازی بهترتیب با فراوانیهای 13، 39، 48 و 31، 49، 20 درصد را نشان داد. ژنوتیپ k در جایگاه ژنی 3ʹ-utr و ژنوتیپ m در جایگاه ژنی 5ʹ-utr دارای بیشترین فراوانی ژنوتیپی بود. تجزیه و تحلیل نشانگر- صفت با استفاده از نرمافزار آماری sas هیچ ارتباط معنیدار آماری را بین الگوهای باندی مشاهدهشده در جایگاههای نشانگری و صفات مرتبط با رشد ماهیان مورد بررسی (فاکتور وضعیت، طول و وزن بدن) نشان نداد. با توجه به اهمیت جایگاه igf-i بهعنوان یک ژن کاندید احتمالی موثر بر صفات مرتبط به رشد، مطالعه این جایگاه ژنی در جمعیتهایی با اندازه بزرگتر پیشنهاد میشود.
|
کلیدواژه
|
تاسماهی ایرانی، چندشکلی، 3،pcr-sscp ،3/-utr 5/-utr acipenser persicus
|
آدرس
|
دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری, گروه شیلات, ایران, دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری, گروه علوم دامی, ایران, دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری, گروه علوم دامی, ایران, دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری, گروه شیلات, ایران
|
پست الکترونیکی
|
skyeganeh@gmail.com
|
|
|
|
|
|
|
|
|
detection of polymorphism in igf-i gene and its association with condition factor in the persian sturgeon fish (acipencer persicus)
|
|
|
Authors
|
|
Abstract
|
the goal of this study was to detect polymorphisms in insulin like growth factor-i gene of persian sturgeon fish (acipencer persicus) using pcr-sscp technique and also to investigate their association with fish growth traits (condition factor, body length & weight). in this research, 95 persian sturgeons were randomly selected and fin clip for dna extraction were taken from caudal fin. dna was extracted using modified salting out method and two fragments of 171 and 362 bp in 5/-utr and 3/-utr regions of igf-i gene were amplified, respectively. genotyping of individuals showed three different banding patterns of m, k and g for the fragment of 171 and 362 bp with the frequency of 13, 39, 48 and 31, 49, 20 percent in persian sturgeon samples, respectively. the genotype k at 3/-utr and genotype m at 5/-utr marker site were the most frequent genotypes. marker-trait analysis using sas statistical software indicated no significant association between observed banding patterns of marker loci and growth traits in persian sturgeon. considering the important role of igf-i as a probable candidate gene effective on growth related traits, survey of this marker sites are recommended for larger-size populations
|
Keywords
|
persian sturgeon ,polymorphism ,pcr-sscp ,acipencer persicus ,pcr-sscp ,acipenser persicus
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|