|
|
بررسی ساختار و تنوع ژنتیکی جمعیت های وحشی گیاه دارویی آنغوزه با استفاده از نشانگر مولکولی issr
|
|
|
|
|
نویسنده
|
صادقی ریحانه ,امیدی منصور ,عزیزی نژاد رضا ,نقدی بادی حسنعلی ,اطمینان علیرضا
|
منبع
|
ژنتيك نوين - 1400 - دوره : 16 - شماره : 4 - صفحه:309 -319
|
چکیده
|
دراین پژوهش تنوع ژنتیکی و ساختار جمعیت 90 ژنوتیپ آنغوزه با استفاده از 13 آغازگر issr مورد ارزیابی قرارگرفت. نتایج نشان داد که آغازگرهای issrدر مجموع 186 باند چند شکل با متوسط 14.38 باند به ازای هرآغازگر در جمعیت مورد بررسی تکثیر نمودند. میانگین مقادیر شاخص نشانگر (mi) و محتوای اطلاعات چند شکل (pic) برای آغازگرهای issr بهترتیب 4.98 و 0.37 بهدست آمد و نشان داد که آغازگرهای issr از کارایی بالایی در شناسایی تنوع ژنتیکی در جمعیتهای آنغوزه برخوردارند. درمقایسه بین جمعیتهای مورد مطالعه جمعیت کرمان شامل 33 ژنوتیپ بر اساس مقادیر تعداد اللهای موثر (ne)، مقادیر هتروزیگوسی (h)، شاخص شانون (i) و تعداد کل الل های مشاهده شده (na) که بهترتیب 1.62، 0.35، 0.51 و 1.93 دراین جمعیت از تنوع بیشتری برخوردار بود. نتایج بهدست آمده از این پژوهش نشان داد که جمعیت کرمان نسبت به سایر جمعیتهای مورد مطالعه از میزان تنوع ژنتیکی بالاتری برخوردار است. نتایج حاصل از تجزیه واریانس ملکولی (amova) نشان داد که 8 درصد از تغییرات کل مربوط به تنوع بین جمعیتی است در حالیکه 92% از تغییرات با تنوع درون جمعیتی قابل توجیه میباشد. بهعبارت دیگر میتوان بیان داشت که آغازگرهای issr بیشترین میزان تنوع ژنتیکی را درون خویشاوندان نشان دادند. تجزیه خوشهای و ساختار جمعیت تمامی ژنوتیپهای ارزیابی شده را بهترتیب به 5 دسته اصلی تقسیم تفکیک کردند. با توجه به نتایج بهدست آمده از این تجزیه مقدار k در حالت 5 درحد بهینه قرارداشت. این نتایج نشان داد که تنوع ژنتیکی نسبتاً بالایی در جمعیت های مورد مطالعه وجود داشته و نشانگر issr ابزار مناسبی جهت بررسی تنوع ژنتیکی در این ژرم پلاسم هستنند.
|
کلیدواژه
|
پارامترهای تنوع ژنتیکی، تنوع ملکولی، گیاهان دارویی، نشانگر مولکولی
|
آدرس
|
دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات تهراندانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات تهران, گروه بیوتکنولوژی و بهنژادی گیاهی, ایران, دانشگاه تهران، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی, ایران, دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات تهراندانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات تهران, گروه بیوتکنولوژی و بهنژادی گیاهی, ایران, جهاد دانشگاهی, پژوهشکده گیاهان دارویی, مرکز تحقیقات گیاهان دارویی, ایران, دانشگاه آزاد اسلامی واحد کرمانشاه, گروه بیوتکنولوژی و بهنژادی گیاهی, ایران
|
پست الکترونیکی
|
alietminan55@yahoo.com
|
|
|
|
|
|
|
|
|
evaluation of structure and genetic diversity of wild populations of ferula assa foetida l. medicinal plant using issr molecular marker
|
|
|
Authors
|
sadeghi reyhane ,omidi mansour ,azizinezhad reza
|
Abstract
|
in this study,the genetic diversity and population structure of 90 ferula assa foetida l. genotypes were evaluated using 13 issr primers. the results indicated that issr primers reproduced a total of 186 polymorphic bands with an average of 14.38 bands per primer. the mean values of marker index (mi) and the polymorphic information content (pic) for issr primers were 4.98 and 0.37, respectively, and showed that issr primers were highly efficient in the identification of genetic diversity in ferula populations. in comparison between the studied populations, the population of kerman includes 33 genotypes based on the values of the number of effective alleles (ne), heterozygous values (h), shannon index (i), and the total number of alleles (na) observed was more diverse. the analysis of molecular variance (amova) results showed that 8% of the total changes are related to between population diversity, while 92% of the changes are justified by within population diversity. in other words, issr primers showed significant genetic diversity between and within wild relatives. cluster analysis and population structure divided all evaluated genotypes into 5 main categories, respectively. according to the results obtained from this analysis, the value of k=5 was in the optimal range. these results illustrate that there is a relatively high genetic diversity in the ferulas population and issr markers are beneficial tools for studying genetic diversity in this germplasm.
|
Keywords
|
molecular diversity ,medicinal plants ,genetic diversity parameters ,molecular marker
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|