بررسی الگوی بیان Pdumir160a ، Pdumir168 و Pdumir171a و ژن های هدف آن ها در اندام های زایشی بادام در پاسخ به تنش سرما

سرمای دیررس بهاره به‌عنوان مهم ترین محدودیت محیطی برای بادام محسوب می شود و به‌واسطه صدمه به بافت های زایشی همه ساله منجر به خسارت قابل توجهی در تولید محصول آن می شود. از آن جایی که اطلاعات بسیار محدودی دررابطه با پاسخ این گیاه به تنش سرمازدگی بهاره وجود دارد و از طرف دیگر با توجه به نقش مهم تنظیمی mirna‌ها در بسیاری از شبکه های تنظیمی، بر اساس اطلاعات حاصل از آنالیز نتایج توالی‌یابی rna و srna‌های بادام، سه ژن pdumir160a، pdumir168 و pdumir171a به‌عنوان mirna‌های پاسخ دهنده به تنش سرما به‌همراه ژن های هدف شان انتخاب و به‌منظور تایید نتایج توالی یابی، بیان آن ها با استفاده از روش rtqpcr در اندام های زایشی دو ژنوتیپ متحمل h و حساس به سرمای sh12 تحت دو تیمار تنش صفر و 2 درجه سانتی‌گراد مورد بررسی قرار گرفت. نتایج، نقش تنظیمی منفی سه mirna مورد مطالعه را در پاسخ به هر دو تیمار تنش سرمایی در ژنوتیپ h نشان داد. اما بر خلاف ژنوتیپ h، نقش تنظیمی مثبت pdumir168 و pdumir171a در پاسخ به تنش سرما در رقم sh12 آشکار شد. نتایج آزمون همبستگی پیرسون، وجود همبستگی منفی بین pdumir160a و pduarf18 تحت هر دو تنش سرمایی را تنها در اندام های زایشی بساک و تخمدان رقم sh12 نشان داد. این در حالی بود که وجود همبستگی منفی میان pdumir168 وpduago1 تنها در تخمدان ژنوتیپ h تحت هر دو تنش تیمار سرمایی مشاهده شد. همچنین اثر تنظیمی منفی pdumir171a بر ژن هدف pduscl6 تحت تنش 2 درجه سانتی گراد در تخمدان ژنوتیپ h و هر دو بافت زایشی رقم sh12 آشکار شد.

Study the expression pattern of PdumiR160a, PdumiR168 and PdumiR171a and their target genes in reproductive tissues of almond in response to cold stress

Cold spring frost is considered as the most important environmental constraint for almond and due to damage to reproductive tissues annually, it causes significant damage to its product. Since little information is available regarding the molecular response of this plant to the frost stress and considering the important role of regulatory microRNA (miRNAs) in many regulatory networks, based on the data from RNA and sRNA sequencing analysis of almond, three microRNA namely, PdumiR160a, PdumiR168 and PdumiR171a with their target genes were selected as cold stressresponsive microRNA. Confirmation of miRNAs expression patterns by quantitative realtime PCR (RTqPCR) was performed in reproductive tissues of coldtolerant genotype (H) alongside a sensitive variety (Sh12) under two stress conditions of 0 and 2 ° C. The results showed the negative regulatory role of two miRNAs in response to both cold stresses, but unlike the H genotype, the positive regulatory role of PdumiR168 and PdumiR171a were revealed under cold stress in both reproductive tissues of Sh12 variety. Pearson correlation test showed a negative correlation between PdumiR160a and PduARF18 under both cold stress treatments in the reproductive tissues of Sh12 variety. However, the negative correlation was observed between PdumiR168 and PduAGO1 in ovary tissue of H genotype under two cold stress conditions. Also, in this study, the negative regulatory role of PdumiR171a on the PduSCL6 target gene was revealed under 2 ° C in ovary tissue of H genotype and both reproductive tissues of Sh12 variety.