تنوع ژنتیکی ارقام و ژنوتیپ‌های پسته از نظر مقاومت به بیماری پوسیدگی طوقه و ریشه (phytophthora drechsleri) و ارتباط آن با مارکرهای مولکولی scot

دانش تنوع ژنتیکی همراه با مدیریت صحیح ژرم پلاسم را می توان در انتخاب ژنوتیپ ها در برنامه های به نژادی و حفاظت منابع ژنتیکی استفاده نمود. روش های ملکولی همراه با روش های آماری چندمتغیره، پتانسیل قابل توجهی جهت بررسی تنوع ژنتیکی گیاهان دارند. در این پژوهش، تعداد 20 رقم پسته در گلخانه نسبت به قارچ عامل پوسیدگی ریشه و طوقه ارزیابی شدند و صفات نمره بیماری (score)، درصد مرگ و میر و وزن خشک گیاه اندازه گیری شد. جهت بررسی تنوع ژنتیکی مقاومت به این بیماری از 12 آغازگر مولکولی scot استفاده شد. ارزیابی فنوتیپی، ارقام پسته را به 4 گروه مقاوم، نیمه مقاوم، نیمه حساس و حساس تقسیم نمود. در ارزیابی تنوع ژنتیکی با آغازگرهای scot، از 122 باند تولید شده 105 باند، چند شکل بودند. تجزیه خوشه ای ژنوتیپ ها براساس باندهای بدست آمده مطابقت خوبی با گروه بندی فنوتیپی نداشت؛ لذا به منظور شناسایی باندهایی که بیشترین ارتباط را با صفات فنوتیپی مربوط به مقاومت به گموز داشتند، از روش های رگرسیون جزئی (pls) و رگرسیون گام به گام استفاده شد. در رگرسیون گام به گام 7 مکان انتخاب شدند که مقاومت به بیماری گموز را 77 تا 86 درصد توجیه نمودند و با تجزیه خوشه ای براساس این 7 مکان، دو گروه حاصل گردید که از طریق تجزیه ارتباط (جدول توافق) رابطه این گروه بندی با گروه بندی براساس صفات فنوتیپی اثبات شد .این 7 مکان، عکس العمل ژنوتیپ های پسته در مقابل بیماری گموز را به مقدار زیادی توجیه نمودند که از آغازگرهای scot12، scot16، scot17 و scot20 تولید شدند؛ لذا برای مطالعه تنوع ژنتیکی ارقام پسته در مقابل گموز می توان این آغازگرها را پیشنهاد نمود.

Genetic diversity of pistachio cultivars and genotypes in terms of resistance to crown and root rot (Phytophthora drechsleri) and its relationship with .SCoT molecular markers

Knowledge of genetic diversity along with the management of germplasm can be used to select genotypes in breeding programs and to protect plant genetic resources. Molecular methods, along with multivariate statistical methods, have a high potential for studying relative relationships, evolution and genetic variation of plants. In this research, 20 pistachio cultivars and genotypes were evaluated in the greenhouse for root and crown rot (gummosis). The traits; disease score, mortality and dry weight were measured. Twelve SCoT primers were used to evaluate the genetic diversity of these cultivars in response to gummosis. The results of greenhouse experiment, divided the cultivars into four groups as: resistant, moderatelyresistant, moderatelysensitive and sensitive. The results showed that the SCoT primers, produced 122 loci, of which 105 loci were polymorphic. Cluster analysis of genotypes based on obtained bands did not fit well with phenotypic grouping. In order to identify the bands that have the most relationship with phenotypic attributes related to gummosis, PLS and stepwise regression methods were used. Through stepwise regression, 7 loci were entered into the model, which explained the resistance to gummosis by77 to 86 percent. By cluster analysis based on the reduced variables (7 markers), two groups were obtained that association analysis (contingency table) showed association between this grouping with the phenotypic grouping. These 7 loci greatly explained the genetic variation of pistachio genotypes in response to gummosis disease. In general, according to the results, SCOT12, SCoT16, SCoT17 and SCoT20 primers could be used to study the genetic diversity of pistachio cultivars against gummosis.