بررسی تنوع ژنتیکی و تجزیه ساختار جمعیت در برخی از گونه‌های آژیلوپس با استفاده از نشانگرهای Cbdp

در این پژوهش تنوع ژنتیکی و ساختار جمعیت 80 توده آژیلوپس بومی ایران با استفاده از آغازگرهای cbdp (caatbox derived polymorphism) مورد بررسی قرار گرفت. با استفاده از 12 آغازگر در مجموع 94 قطعه تکثیر شد که تمامی قطعات چندشکل بودند. با توجه به میانگین شاخص های pic، rp و mi مشخص شد آغازگرهای استفاده شده کارایی لازم جهت بررسی روابط بین ژنوتیپ ها و ساختارهای ژنتیکی را دارند. تجزیه واریانس مولکولی (amova) نشان داد میزان تنوع بین گونه ها نسبت به درون گونه ها بیشتر است. براساس مقادیر شاخص های تنوع ژنتیکی مشخص شد بیشترین تعداد آلل های مشاهده شده (na)، تعداد آلل های موثر (ne)، شاخص تنوع ژنی (he)، بیشترین میزان شاخص شانون (i) و درصد جایگاه های چندشکل (ppl) مربوط به گونه ae. triuncialis بود. تجزیه خوشه ای و ساختار جمعیت تمامی ژنوتیپ های ارزیابی شده را به ترتیب در سه گروه اصلی مطابق با ساختار ژنومی آن ها دسته بندی کردند. به طورکلی نتایج به دست آمده نشان داد تنوع ژنتیکی بالایی در توده های آژیلوپس ایران وجود دارد. بنابراین این مجموعه می تواند به عنوان یک منبع ژنی با ارزش در برنامه های اصلاحی گندم مورد استفاده قرار گیرد.

Evaluation of genetic diversity and population structure analysis in some Aegilops species using CBDP markers

In the present study, genetic diversity and population structure in the 80 Iranian Aegilops accessions were investigated using CBDP markers (CAATbox derived polymorphism) markers. Twelve CBDP primers amplified a total of 94 fragments, which out all of them were polymorphic. The mean values of polymorphic information content (PIC), resolving power (Rp) and marker index (MI) indicated that the used primers could exploited for further assessing relationships among investigated genotypes and population structure analysis. The results of molecular analysis of variance (AMOVA) showed that the genetic variation between populations is more than variation within them. Based on genetic variation parameters, the highest number of observed alleles (Na), number of effective alleles (Ne), gene diversity (He), Shannon rsquo;s information index (I) and percentage of polymorphic loci (PPL) were found in Ae. triuncialis species. Cluster analysis and population structure grouped all investigated genotypes into three main clusters, so that the grouping patterns were consistence with their genomic constitutions. In conclusion, our results revealed the high rate of genetic diversity in Iranian Aegilops accessions. Due to high adaptation of wild relatives to their habitats, hence they can be used as a valuable gene source for wheat breeding programs.