|
|
ارزیابی تنوع ژنتیکی اکسشنهای علف گندمی تاجدار (agropyron cristatum) با استفاده از نشانگر issr
|
|
|
|
|
نویسنده
|
زرافشانی فاطمه ,صفری هوشمند ,اطمینان علیرضا
|
منبع
|
ژنتيك نوين - 1399 - دوره : 15 - شماره : 1 - صفحه:69 -73
|
چکیده
|
تنوع ژنتیکی 15 اکسشن از گونه علف گندمی تاجدار با استفاده از 15 آغازگر issr مورد بررسی قرار گرفت. از این 15 آغازگر 12 عدد دارای باندهای قابل امتیاز دهی بودند. آغازگرهای issr در مجموع توانستند 71 باند تولید کنند، که 66 باند چند شکل بودند. آغازگرهای 1is و 857ubc بیشترین تعداد باند (هشت باند) و آغازگرهای 7is و 869ubc کمترین تعداد باند (سه باند) را تولید کردند. آغازگر 844ubc کمترین درصد چندشکلی را به میزان 83.33 درصد نشان داد و بیشترین درصد چندشکلی برای آغازگرهای 2is، 6is، 7is، 848ubc، 865ubc، 868ubc و 869ubc به میزان 100% بود. میانگین درصد چندشکلی 94.15% بود. میانگین تعداد باند تولید شده توسط هر آغازگر برای 15 ژنوتیپ برابر 5.92 بود و متوسط تعداد باندهای چندشکل 5.50 بود. آغازگرهای 6is، 865ubc و 869ubc بهتر از سایر آغازگرها توانستند فاصله ژنتیکی ژنوتیپها را مشخص کنند. ژنوتیپهای 4g با 2g دارای بیشترین تشابه بودند و ژنوتیپهای 1g با 8g کمترین تشابه را نشان دادند. نتایج تجزیه خوشهای به روش upgma بر اساس ضریب تشابه جاکارد ژنوتیپها را در سه گروه قرار داد، که نتایج با تجزیه به مختصات اصلی و تجزیه واریانس مولکولی تایید شد. تنوع ژنتیکی اکسشن ها براساس نشانگر مورد بررسی با پراکنش جغرافیایی آنها مطابقت نشان داد و جمعیتهای گرگان و اصفهان شباهت بالایی داشتند که از طرف دیگر با جمعیتهای کرج فاصله بیشتری نشان دادند.
|
کلیدواژه
|
نشانگر مولکولی، آگروپایرون، تنوع زیستی، پراکتش جغرافیایی
|
آدرس
|
دانشگاه آزاد اسلامی واحد کرمانشاه, گروه ژنتیک و به نژادی گیاهی, ایران, سازمان آموزش و تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی, مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی کرمانشاه, بخش تحقیقات منابع طبیعی, ایران, دانشگاه آزاد اسلامی واحد کرمانشاه, گروه ژنتیک و به نژادی گیاهی, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Genetic diversity assessment of Agropyron cristatum accessions using ISSR marker
|
|
|
Authors
|
Zarafshan F ,Safari H ,Etminan A
|
Abstract
|
Genetic variation was investigated for the number of 15 Agropyron cristatum accessions using the 15 ISSR primers, among them 12 primers were scored. The ISSR primers produced the number of 71 bands. The polymorphism has been observed for the number of 66 bands. The primers of IS1 and UBC857 presented the highest number of bands, i. e. eight bands; while the IS7 and UBC869 showed the lowest number which is only three bands. The primer of UBC844 were showed the lowest polymorphism percentage (83.33%) and IS2, IS6, IS7, UBC848, UBC865, UBC868 and UBC869 had the highest polymorphism percentage (100%). The polymorphism percentage average was 94.15%. The average of bands was 5.92 in each primer for 15 genotypes and the average of polymorphic bands was 5.50. IS6, UBC865 and UBC869 could determinate genetic distance of genotypes better than other primers. The genotypes of G4 with G2 had the most similarity and G1 with G8 had the lowest similarity. The results of UPGMA cluster analysis based on Jacardchr('39')s similarity coefficient were classified the genotypes in three groups, which confirmed by principal coordinate analysis and molecular variance analysis. The genetic diversity of the populations was matched based on the studied marker with their geographic distribution, and the populations of Gorgan and Isfahan were similar, which, on the other hand, showed greater distance with Karaj populations.
|
Keywords
|
Molecular marker ,Agropyron ,Genetic diversity ,Geographic distribution.
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|