ارزیابی تنوع در مکان ژنی خودناسازگاری و جداسازی اولین آلل این مکان ژنی در ژنوتیپ های بومی درخت به (Cydonia Oblonga Mill.) ایران

درخت به (cydonia oblonga mill.) از نظر سازگاری گرده، گونه‌ای خودسازگار محسوب می‌شود، لیکن سطوح متفاوتی از خود ناسازگاری در ارقام و ژنوتیپ‌های آن گزارش شده است. با توجه به عدم بررسی آلل‌های خودناسازگاری مکان ژنی و تنوع احتمالی آللی این مکان ژنی (s) در درخت به و تاثیر آن در میزان خود ناسازگاری، در این تحقیق به ارزیابی تنوع در مکان ژنی خودناسازگاری، جداسازی، تعیین توالی و ودیعه‌گذاری اولین آلل خودناسازگاری در شماری از ارقام و ژنوتیپ‌های بومی این درخت پرداخته شد. آغازگرهای مورد استفاده بر اساس نواحی محافظت شده c1 و c5 مکان ژنی s در گونه‌های نزدیک مشتمل بر سیب و گلابی طراحی شدند. ژنوتیپ‌های مورد بررسی مشتمل بر 55 رقم و ژنوتیپ از استان‌های اصفهان، خراسان‌رضوی، اردبیل و گیلان بودند و تکثیر این مکان ژنی نشان‌دهنده تنوع آن در ژنوتیپ‌ها بود. قطعات تکثیری با طول بین 500 تا 1100 باز در 13 اندازه مختلف در ارقام و ژنوتیپ‌ها مشاهده شدند که به‌صورت sq1 تا sq13 به‌صورت مقدماتی کدگذاری شدند. بیش‌ترین فراوانی آللی مربوط به آلل sq13 با 17.7 درصد فراوانی و پس از آن آلل sq4 با 14.4 درصد فراونی بود. تعیین ‌توالی کامل این مکان ژنی در ژنوتیپ km1 یا به ترش‌اصفهان ضمن تشخیص اولین آلل خودناسازگاری این گونه که به‌صورت s1 (mf281258) نام‌گذاری و ودیعه گذاری شد، بیانگر بالاترین شباهت این آلل با دو آلل خودناسازگاری s6 گونه سیب malus domestica borkh. و آلل ss (s111) گونه گلابی pyrus communis l. به‌ترتیب با 94 و 93 درصد شباهت نوکلئوتیدی بود.

Evaluation of Diversity of Self Incompatibility Locus and Isolation of the First Allele of this locus in Indigenous Quince (Cydonia oblonga Mill.) Genotypes of Iran

Quince (Cydonia oblonga Mill.) is considered as a selfcompatible species, but some levels of selfincompatibility also have been reported in its cultivars and genotypes. Therefore in this research allelic diversity, isolation and deposition of alleles has been considered in some indigenous quince cultivars and genotypes of Iran. The primes were designed according to the C1 to C5 conserved regions of apple and pear species. 55 genotypes, cultivars and related species of quince were evaluated and amplification of this locus demonstrated various band lengths between 500 to 1100 bp with 13 various sizes. After partial sequencing, these bands primarily were coded as Sq1 to Sq13, but the frequency of two putative alleles, Sq13 and Sq4 where higher than other respectively with 17.7 and 14.4%. Sequencing of the first selfincompatibility allele (S1) in KM1 genotype or cultivar Torsh Esfahan revealed the highest homology of this allele with S6 of apple species Malus domestica Borkh. and Ss (S111) of pear species Pyrus communis L., respectively, with 94 and 93 of nucleotide similarity.