مطالعات ژنتیکی روی ژن هسته یخ باکتری bacillus cereusعامل سرمازدگی گیاه پیاز (allium cepa)

باکتری های فعال هسته یخ به دلیل تسریع فرآیند یخ زدگی در دمای °c 5 و دماهای بالاتر، یکی از عوامل مهم سرمازدگی در سطح مزارع و باغ های کشور هستند. به منظور شناسایی باکتری های دارای ژن هسته یخ، چندین نمونه باکتریائی با قدرت هسته یخ جداسازی شد که نهایتاً باکتری عامل سرمازدگی گیاه پیاز انتخاب شد. جهت ارزیابی فعالیت هسته یخ از آزمون انجماد درون لوله ای و انجماد قطره ای استفاده شد. شناسایی به روش معمول صفات فنوتیپی انجام گرفت و جدایه باکتریائی در سطح جنس bacillus شناسائی شد. با تکثیر ژن 16srrna و بلاست توالی در سایت ncbi تعلق آن به گونه bacillus cereus محرز شد. به دلیل عدم وجود ژن مولد هسته یخ برای جدایه مذکور در سایت ncbi آغازگری مشابه با آغازگرهای تعریف شده برای ژن هسته یخ درpseudomonas syringae با این فرض که ژن ina درb. cereus مشابه با ژن هسته یخ (inaz) در pseudomonas syringae است طراحی شد و برای ردیابی ژن هسته یخ (ina) آنالیز واکنش زنجیره ای پلیمراز انجام گرفت. در ادامه تحقیق با استفاده از آغازگر 16srrna، فرآیند همسانه سازی و استخراج پلاسمید به منظور انجام توالی یابی دقیق تر انجام گرفت. این اولین گزارش از وجود ژن هسته یخ در گونه bacillus cereus است.

Genetic studies on Bacillus cereus, the cause of cold damage on onion plant (Allium cepa)

The ice nucleation active (INA+) bacteria are one of the most important biological factors in fields and orchards frost damage. Most of these bacteria usually accelerate the freezing process at 5 °C and higher temperatures. In order to identify INA+ bacteria, many plant samples were screened and one positive Ice bacterium associated with onion bulb was selected. The bacterium was then tentatively identified using some key bacteriological methods. Accurate identification of the strain A at species level was made by PCR amplification of 16SrRNA followed by blast at NCBI. Ice nucleation activity of the bacterium was tested by tube INA assay and droplet freezing method. Due to the absence of a nucleusproducing gene for representative isolate at the NCBI site, a primer set similar to inaZ gene of Pseudomonas syringae was designed and PCR analysis was performed. PCRamplicons were further analyzed by plasmid DNA analysis as well as cloning and sequencing. The results were indicated that there might be different types of ice gene in Bacillus cereus strain A. This is the first report of an Iceplus Bacillus cereus from plant samples.