|
|
|
|
شناسایی mirnaها و ژن‌های هدف بالقوه آن‌ها در گلرنگ زراعی (carthamus tinctorius l)
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
کوهی فرشید ,سرخه کریم ,ایرسیزلی سزای
|
|
منبع
|
ژنتيك نوين - 1397 - دوره : 13 - شماره : 3 - صفحه:363 -379
|
|
چکیده
|
Micrornaها (mirna) گروهی از rnaهای غیر کدکننده و کوتاه (~21 نوکلئوتید) هستند که از طریق تنظیم بیان ژن ها در سطح پس از رونویسی نقش کلیدی را در توسعه و فیزیولوژی گیاه ایفا می کنند. ازآنجایی که تاکنون مطالعه جامعی در رابطه با شناسایی mirnaهای گلرنگ به روش in silico انجام نشده است، در این پژوهش با آنالیز توالی های ژنومی، 124 mirna بالقوه متعلق به 26 خانواده حفاظت شده، شناسایی و حضور 2 مورد از آن ها در ژنوم گلرنگ با استفاده از rtqpcr تایید شد. این 29 خانواده mirna به طور چشم گیری در اندازه متفاوت هستند. آنالیز توالی های pre mirna نشان داد که طول این پیش سازها در گلرنگ از 57 تا 317 با میانگین 40.1 ± 95.88 نوکلئوتید متغیر است. دیگر نتیجه مهم به دست آمده در این مطالعه، موفقیت در تعیین کلاسترهای mir169، mir395 و mir397 در ژنوم گلرنگ بود. در مطالعه پیش رو برای نخستین بار اعضای خانواده های mir393، mir477، mir530، mir6111، mir6113 و mir6114 در ژنوم گلرنگ شناسایی شد. با استفاده از پروتکل های ارائه شده در مطالعات پیشین، درمجموع 84 ژن هدف بالقوه برای mirnaهای گلرنگ شناسایی شد. ژن های هدف این قبیل از ژن ها، فاکتورهای رونویسی، پروتئین های دخیل در همانندسازی dna و آنزیم های متابولیکی را شامل می شوند. نتایج این مطالعه نشان داد که mirnaهای حفاظت شده در گلرنگ وجود دارند و می توانند عملکرد موثری در پاسخ به تنش های محیطی نیز داشته باشند.
|
|
کلیدواژه
|
کلاستر،carthamus tinctorius، in silico ،mirna،rt-qpcr
|
|
آدرس
|
دانشگاه شهید چمران اهواز, دانشکده کشاورزی, گروه اصلاح نباتات, ایران, دانشگاه شهید چمران اهواز, دانشکده کشاورزی, ایران, دانشگاه آتاتورک ترکیه, دانشکده کشاورزی, ترکیه
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Identification of conserved miRNAs and their putative target genes in safflower (Carthamus tinctorius L)
|
|
|
|
|
Authors
|
Kouhi F ,Sorkheh K ,Ercisli S
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|