آنالیز بیوانفورماتیکی est ژن‌های القاء شده در برنج بعد از تیمار به‌وسیله بنزوتیادیازول

مقاومت القایی (ir) نوعی از مقاومت است که هم با آلودگی با مواد بیولوژیکی قبل از آلودگی با پاتوژن و هم به وسیله تیمار با مواد شیمیایی فعال می شود. یکی از مهم ترین انواع آن، که بیش ترین مطالعات بر روی آن انجام شده، مقاومت اکتسابی سیستمیک (sar) است که نقش مهمی در مقاومت به بیماری ها در گیاهان به عهده دارد. برخی از مواد شیمیایی باعث ایجاد sar در گیاهان می شوند. بنزوتیادیازول (bth) از جمله مواد شیمیایی موثر است که کاربرد خارجی آن به عنوان یک ترکیب جدید برای کنترل بیماری ها شناخته شده می باشد که پاسخ آن در سرتاسر گیاه انتقال می یابد و پاسخ های دفاعی در مقابل بیماری را افزایش می دهد. به منظور بررسی مکانیسم های فعالیت بیوشیمیایی bth و ژن های القا شده توسط آن، داده های توالی estهای مربوط به bth در برنج از سایت ncbi اخذ شدند. با دسته بندی و هم گذاری حدود 370 توالی est برنج بعد از تیمار با bth 33 کانتیگ و 234 سینگلتون تشکیل شد، سپس گروه های کارکردی مشخص و با انجام مقایسه بین دو کتابخانه ژن های مشترک تعیین شدند. نتایج حاصل از این تحقیق مشخص کرد که پس از کاربرد bth در برنج پروتئین های کیناز، lhcb، oeep، هم چنین آنزیم کربنیک انهیدراز و نیز آنزیم ribulose بیان می شوند. در این مطالعه برای نخستین بار تاثیر bthبر دستگاه فتوسنتزی گیاهان مشاهده شد، هم چنین مسیرهای سیگنال دهی دفاعی در برنج را پس از تیمار با bth مشخص کرد. در این مطالعه ژن هایی که ممکن است در تنظیم مکانیسم های دفاعی گیاه در برابر بیماری ها دخالت داشته باشند شناسایی شدند. این نوع مطالعات بیوانفورماتیکی می تواند در طرح های اصلاحی برای توسعه واریته های متحمل در برابر بیماری ها کمک کننده باشد.