ارزیابی ژنومی تک‌مرحله‌ای (single step gblup): مطالعه موردی در ارزیابی ژنومی گاو گوشتی

روش تک مرحله‌ای (ss-gblup) انتخاب ژنومی در مقایسه با روش چند‌مرحله‌ای، با توجه به ادغام ماتریس خویشاوندی روابط ژنومی آللی و ماتریس خویشاوندی شجره‌ای و استفاده هم‌زمان تمام حیوانات ژنوتیپ شده و نشده در مدل‌های ژنومی اخیراً کاربرد وسیعی در برآورد ارزش‌های اصلاحی ژنومی ایفا کرده است. هدف از مطالعه اخیر مقایسه تفاوت صحت ارزیابی ژنومی برای روش‌های blup سنتی، g-blup، snp-blup و ss-gblup برای صفت وزن لاشه در گاو گوشتی بود. نتایج این مطالعه نشان داد که متوسط صحت پیش‌بینی ژنومی روش‌های فوق به‌ترتیب برابر با 0.11±0.77، 0.21±0.88، 0.23±0.87 و 0.25± 0.95 برآورد شد. صحت پیش‌بینی ژنومی در روش ss-gblup نسبت به روش‌های blup سنتی، g-blup و snp-blup به‌ترتیب 0.18، 0.07 و 0.08 بیش‌تر برآورد شد. میانگین مربعات خطای پیش‌بینی برای روش‌های فوق به‌ترتیب 3.46، 2.21، 2.22 و 1.76 به‌دست آمد. روش ss-gblup با توجه به پایین بودن میانگین مربعات خطا و بالا بودن صحت پیش‌بینی ژنومی روش مطلوب‌تری بود. ضرایب رگرسیون پیش‌بینی ژنومی برای روش‌های snp-blup، g- blup و ss-gblup به‌ترتیب 0.81، 0.82 و 0.90 به‌دست آمد و بنابراین اریب برآوردها در ss-gblup نسبت به دو روش‌ دیگر کمتر است.