|
|
ردیابی و بررسی مولکولی دو جدایه جدید ویروس موزائیک ایرانی قیاق (ijmv) در مزارع ذرت استان مازندران
|
|
|
|
|
نویسنده
|
مرادی زهره ,نظیفی احسان ,مهرور محسن
|
منبع
|
ژنتيك نوين - 1396 - دوره : 12 - شماره : 3 - صفحه:483 -488
|
چکیده
|
پوتی ویروس ها متعلق به خانواده potyviridae یکی از بزرگترین گروه های ویروسهای گیاهی با بیشترین اهمیت اقتصادی بوده و عامل 40 درصد بیماری های ویروسی در گیاهان مختلف میباشند. ویروس موزائیک ایرانی قیاق (ijmv) از پوتی ویروس های مهم غلات می باشد و یکی از عوامل مهم موزائیک ذرت در ایران بهشمار میرود. بهمنظور بررسی این ویروس، طی سال های 1393-1392 تعداد 90 نمونه دارای علائم ویروسی از مزارع ذرت استان مازندران جمعآوری و با آزمون الایزای غیر مستقیم توسط آنتی سرم اختصاصی ویروس مذکور مورد بررسی قرار گرفت. rna ویروس از نمونه های الایزا- مثبت استخراج شد، و در آزمون rt-pcr با استفاده از آغازگرهای دژنره مربوط به ناحیه ژنومی cylindrical inclusion (ci) اعضای جنس پوتیویروس، قطعه ای بهطول 680 جفتباز تکثیر شد. بهمنظور بررسی های تکمیلی، محصول pcr دو جدایه از شهرستان بابلسر پس از همسانه سازی در حامل پلاسمیدیptg19-t ، توالی یابی شدند. نتایج داده های ترادف نوکلئوتیدی در blastn وجود ijmv را تایید نمود. با مقایسه و تجزیه توالی بهدست آمده با جدایه های موجود در بانک ژن، مشخص شد که دو جدایه تعیین توالی شده بیشترین شباهت را در سطح نوکلئوتیدی (84.2 درصد) و آمینو اسیدی (97.8 و 97.3 درصد) با جدایه شیراز (با شماره دسترسی jq692088) که میزبان آن قیاق می باشد، دارند. اختلاف نوکلئوتیدی زیاد جدایه های بهدست آمده از ذرت در مقایسه با جدایه بهدست آمده از قیاق نشان-دهنده تنوع ژنتیکی بالای این ویروس است. نتایج این تحقیق، وقوع و گسترش ijmv در استان مازندران را با روش های سرولوژیکی، مولکولی و توالییابی بخشی از ژن ci اثبات میکند.
|
کلیدواژه
|
آنالیز فیلوژنتیکی، الایزا، ژن ci،ijmv، rt-pcr
|
آدرس
|
دانشگاه فردوسی مشهد, دانشکده کشاورزی, گروه گیاهپزشکی, ایران, دانشگاه مازندران, دانشکده علوم پایه, گروه زیست شناسی, ایران, دانشگاه فردوسی مشهد, دانشکده کشاورزی, گروه گیاهپزشکی, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Authors
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|