بررسی ساختار ژنتیکی و تجزیه فیلوژنتیکی جمعیت بز خلخالی با استفاده از ژنوم میتوکندری

گونه های بومی بخشی از سرمایه های ملی و ذخایر استرات‍‍‍ژیک هر کشور محسوب شده و به دلیل کاهش شدید جمعیت آن ها شناسایی، حفاظت و تکثیر این نژادها اهمیت زیادی دارد. در این تحقیق ناحیه کنترل میتوکندریایی (d_loop) برای بررسی تنوع ژنتیکی، ساختار فیلوژنتیک و ژنتیک جمعیت بز خلخالی استفاده شد. نمونه های خونی از 100 بز خلخالی جمع آوری شد. نمونه های dna با استفاده از کیت استاندارد استخراج و با استفاده از پرایمرهای اختصاصی تکثیر شد. بعد از تعیین ژنوتیپ از طریق تشخیص الگوهای متفاوت با استفاده از نشانگر sscp توالی یابی شدند. توالی های مربوط به دیگر گونه های مزرعه ای که همتراز با توالی های حاصل شده بودند به عنوان توالی برون گروهی از طریق ncbi به دست آمد. در 126 توالی به دست آمده در حدود 62 جهش و 37 هاپلوتیپ شناسایی شد. تنوع هاپلوتیپی و تنوع نوکلئوتیدی در بین گونه ها به ترتیب 0.915 و 0.069 بود و در بز خلخالی به ترتیب 0.834 و 0.008 به دست آمد که نشان دهنده تنوع ژنتیکی کم در این نژاد می باشد. نتایج مربوط به مقایسه با سایر نژاد های بز نشان داد که جمعیت بز خلخالی جز هاپلو گروه a در بین انواع هاپلو گروه های شناخته شده در جهان می باشد.