هم ردیف سازی چندگانه و رسم درخت فیلوژنتیک به روش neighbor joining ژن cp ویروس موزاییک کاهو در استان گلستان

اخیراً علائم بیماری ویروسی موزاییک کاهو (lettuce mosaic virus, lmv) در سطح وسیعی از مزارع کاهو استان گلستان شایع شده‌است. این ویروس از بیمارگرهای مخرب و مهم اقتصادی است که متعلق به جنسpotyvirus و خانواده potyviridaeمی‌باشد. طی سال زراعی 93 1392 به‌منظور ردیابی ویروس lmv، 93 نمونه که دارای علائم موزاییک، پیسک، کوتولگی و عدم تولید تاج طبیعی بودند از مزارع کاهو استان گلستان جمع‌آوری شده و آلودگی ویروسی در نمونه‌ها به وسیله آزمون das elisa و آنتی‌سرم منوکلونال lmv بررسی شد. نتایج آزمون سرولوژیکی نشان داد که 80 نمونه از نظر آلودگی به ویروس مثبت بودند، در حالی‌که علائم زردی منفی بود. از نمونه‌های آلوده، تعدادی از آن‌ها به منظور ردیابی ویروس تعیین ترادف شدند.rna کل از نمونه‌های مذکور استخراج شد و در آزمون rt pcr با استفاده از آغازگر عمومی پوتی‌ویروس، قطعه 327 جفت بازی تکثیر شد که مربوط به ژن cp می‌باشد. توالی‌های بدست آمده، با توالی‌های موجود در genbank، مقایسه شدند. هم‌ردیف‌سازی‌های چندگانه و آنالیزهای تبارزایی با نرم‌افزارهای dnastar، dnaman، clustal x انجام و درخت فیلوژنتیک به روش neighbor joining ترسیم شد. نتیجه ترادف توالی نشان داد که نمونه‌های استان گلستان به lmv آلوده می‌باشند و آنالیزهای تبارزایی تعیین کرد که جدایه گلستان شباهت 7/99 درصدی در سطح نوکلئوتیدی با جدایه فرانسه (z78229) داشت. این اولین گزارش از آلودگیlmv و تعیین توالی cp ژنوم این ویروس در استان گلستان می‌باشد.