|
|
|
|
a reverse transcriptaseloop mediated isothermal amplification assay (rt-lamp) for rapid detection of bovine viral diarrhea virus 1 and 2
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
tajbakhsh amir ,rezatofighi elham ,mirzadeh khalil ,pourmahdi mahdi
|
|
منبع
|
archives of razi institute - 2017 - دوره : 72 - شماره : 2 - صفحه:73 -81
|
|
چکیده
|
Bovine viral diarrhea virus (bvdv) is a pathogen that infects cattle, and is globally important. it causes substantial financial losses to the livestock industry. in the current study, a one-step reverse transcriptase-loopmediated isothermal amplification (rt-lamp) assay was set up for rapid and efficient detection of bvdv. for this purpose, four primers were designed to recognize six distinct regions on the target rna based on a highly conserved sequence in the 5΄ utr of the bvdv genome. eighty blood specimens were collected from bovines suspected to suffer from bvdv infection, and were tested in parallel by rt-lamp and rt-pcr. twenty four of these samples were positive by rt-lamp, while twenty were positive by rt-pcr. the rt-lamp detection limit was estimated to be approximately 70pfu /ml of virus. comparison of rt-pcr with rt-lamp in this study revealed the recent developed rt-lamp a highly sensitive and specific for bvd virus detection in the clinical samples.
|
|
کلیدواژه
|
bovine viral diarrhea; reverse transcriptase-loop mediated isothermal amplification assay; reverse transcriptase-polymerase chain reaction
|
|
آدرس
|
shahid chamran university of ahvaz, faculty of science, department of biology, ایران, shahid chamran university of ahvaz, faculty of science, department of biology, ایران, khouzastan ramin agriculture and natural resources university, department of animal science and food, ایران, shahid chamran university of ahvaz, faculty of veterinary medicine, department of food hygiene, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
طراحی و ارزیابی روش رونوشت برداری معکوس و واکنش تکثیری هم دما به واسطه لوپ برای شناسایی اسهال ویروسی گاو ویروس 1 و 2
|
|
|
|
|
Authors
|
تاجبخش امیر ,رضاتوفیقی الهام ,میرزاده خلیل ,پور مهدی مهدی
|
|
Abstract
|
ویروس اسهال ویروسی گاو یک عامل بیماریزا برای گاوها میباشد و دارای اهمیت اقتصادی در همه دنیا است. این عامل باعث تحمیل هزینههای فراوان به صنعت دامپروری میشود. روش تک مرحلهایی رونوشت برداری معکوس و تکثیر هم دما به واسطه لوپ (RTLAMP) برای شناسایی سریع و موثر ویروس اسهال ویروسی گاو طراحی گردید. چهار پرایمر بر اساس ناحیه حفاظت شده غیر ترجمهایی انتهای΄5 (5΄UTR) ژنوم ویروس اسهال ویروسی گاو برای تشخیص شش محل مختلف روی RNA هدف طراحی گردید. هشتاد نمونه خون از دامهای مشکوک به اسهال ویروسی گاو جمع آوری و به طور همزمان با دو روش RTPCR وRTLAMP تست شدند. 24 نمونه از این تعداد با روشRTLAMP مثبت شدند. درحالیکه با روش RTPCR بیست نمونه مثبت شدند. حد شناسایی برای روش RTLAMP تقریبا PFU/mL70 تخمین زده شد. مقایسه روش RTPCR با RTLAMP نشان داد که روش جدید طراحی شده به عنوان یک روش حساس و اختصاصی توانایی تشخیص این ویروس در نمونه های کلینیکی را دارد.
|
|
Keywords
|
اسهال ویروسی گاو، رونوشت برداری معکوستکثیر هم دما به واسطه لوپ، رونوشت برداری معکوس، واکنش زنجیره ایی پلیمراز
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|